ARGminer - ARGminer

ARGminer
Мазмұны
СипаттамаБірнеше дереккөздерден алынған ARG-ді топтастырылған курацияға бағытталған мәліметтер базасы.
Мәліметтер түрлері
қолға түсті
Микробқа қарсы тұрақтылық
АғзаларБактериялар
Кіру
Веб-сайторындық.cs.vt.edu/ argminer.
Әр түрлі
Бетбелгі
субъектілер
иә

ARGminer болып табылады дерекқор бұл қолмен курациядан гөрі тобырлық курацияның жаңа әдісіне бағытталған Антибиотиктерге төзімділік гендері (ARG) сияқты бірнеше көздерден алынды КАРТА, ARDB, NDARO, DeepARG, Uniprot, ResFinder, және SARG.[1] Сонымен қатар, болуына байланысты Мобильді генетикалық элементтер (MGE), ARGminer сонымен бірге ПАТРИКА және ACLAME.[1] ARGminer олардың гендік атауын қолдана отырып, аннотацияланған гендерді, антибиотик категория, қарсылық механизмі, қозғалғыштығының және клиникалық маңызды бактериялық штамдарда пайда болуының дәлелі.[1] Екі топтан тұратын кураторлар бар. Біреуі жалданды Amazon механикалық түркі бұл ақшалай сыйақыға түсініктеме бере алатын көпшіліктен алынған сарапшылар мен сарапшылар емес кең аудиторияны ұсынады. Аралас сараптаманың болуына байланысты әр пайдаланушыға ең көп дегенде 20 аннотацияға рұқсат етіледі. Басқа топ - бұл жоғары деңгейлі микробиология сыныбы.[1]

Сондай-ақ қараңыз

Пайдаланылған әдебиеттер

  1. ^ а б c г. Чжан, Л .; Викесланд, П.Ж .; Пруден, А .; Хит, Л.С .; Рикельме, М.В .; Гарнер, Э .; Гурон, Г.К. П .; Arango-Argoty, G. A. (2019-03-06). «ARGminer: антибиотиктерге төзімділік гендерін краудсорсинг негізінде курациялауға арналған веб-платформа». bioRxiv: 274282. дои:10.1101/274282.