Авибаза - Avibase

Авибаза
Сайт түрі
Таксономиялық мәліметтер базасы
Қол жетімді105 тіл
ЖасалғанДенис Лайб
URL мекен-жайыавибаза.bsc-eoc.org
Іске қосылды2003
Ағымдағы күйБелсенді

Авибаза желіде таксономиялық мәліметтер базасы ұйымдастырады құс таксономиялық және ғаламдық деңгейде тарату. Негізінде мәліметтер базасы деген ұғымға сүйенеді таксономиялық ұғымдар.[түсіндіру қажет ][1][2] таксономиялық атаулардан гөрі[3] (тағы қараңыз)[4][5][6] таксономиялық ұғымдарды қолданудың негізділігі үшін). Avibase негізгі құс таксономиялық баспагерлерінің таксономикалық деректерін біріктіреді және ұйымдастырады (Әлемдегі құстардың Клементтерді бақылау тізімі,[7] Әлем құстарының анықтамалығы, BirdLife International,[8] ХОК бақылау тізімі[9] және Ховард және Мур әлем құстарының толық тізімі[10]) және басқа аймақтық дереккөздер (мысалы,. барлық шығарылымдары Американдық орнитологиялық қоғам Солтүстік Америка құстарын тексеру тізімі 1886 жылдан бастап). 230-дан астам әр түрлі таксономиялық көздердегі таксономиялық тұжырымдамалар картаға түсіріліп, Avibase тұжырымдамаларына сәйкес келтірілген.

Веб-сайт сонымен қатар әлемнің 20000-нан астам географиялық аймақтары үшін бақылау парақтарын, таксономиялық ақпарат пен синонимдері бар түрлер парақтарын және бақылаушыларға өз көзқарастарын сақтауға және есептер алуға арналған құралдарды ұсынады (мысалы, елдерді көрсететін карта немесе eBird тіршілік тізімінің бірінде жоқ мақсатты түрлердің саны бар ыстық нүктелер).

Тарихы және мақсаты

Avibase құрды және оны қолдайды, қазіргі уақытта деректану және технологиялар бойынша аға директор, қазіргі уақытта Денис Лайбс Құстар Канада. Авибазадағы мәліметтер 1991 жылдан бастап жинақталған.[11] Avibase веб-сайты 2003 жылы маусымда іске қосылды және оны орналастырған Құстар Канада (бұрынғы Канада құстарды зерттеу) пайда болғаннан бері.

Ерекшеліктер

Таксономиялық ұғымдар. Деректер базасы, ең алдымен, бірегей таксономиялық ұғымдар кестесінің айналасында ұйымдастырылған. Әрбір тұжырымдама бірегей биологиялық шеңберді білдіреді және оған бірегей әріптік-сандық идентификатор берілген Avibase идентификаторы. Avibase идентификаторлары жарияланым көздері арасында үйлесімді таксономиялық тұжырымдамаларды бақылауға мүмкіндік береді. Avibase-де сипатталған шамамен 58000 бірегей таксономиялық тұжырымдамалар бар. Оларға дәстүрлі түрде танылған ұғымдар және кіші түрлер сонымен қатар басқа таксономиялық топтар (кіші түрлер топтары), тарихи танылған әр түрлі альтернативті таксономиялық емдеу және басқа ұғымдар будандар, түсті морфтар және жарамсыз немесе күмәнді нысандар.

Номенклатуралық мәліметтер. Әрқайсысы ғылыми атауы сонымен қатар дәйексөз деректерін және бастапқы сипаттамамен байланысты атауды қосу үшін сипатталады. Шамамен 48000 акт[түсіндіру қажет ] Авибазада және оның әр түрлі түрлерінде жазылған синонимдер қол жетімді.

Аймақтық түрлерді бақылау тізімдері әлемнің 20000-нан астам аймақтары үшін қол жетімді. Оған барлық елдер, территориялар және тәуелділіктер, сондай-ақ GADM провинциялар, штаттар, префектуралар, округтер, департаменттер, муниципалитеттер мен аудандар (1 және 2 деңгейдегі GADM деңгейлері), сондай-ақ 2500-ден астам аралдар сияқты ұлттық қабаттар. Аймақтық бақылау парақтары бірнеше таксономиялық форматта қол жетімді және оларды қоса алады жалпы атаулар әр түрлі тілдерде. Аймақтық бақылау тізімдеріне арналған мәліметтер eBird EBD мәліметтер жиынтығы және Facebook Global Rare Bird Alert сияқты форумдар сияқты көптеген ақпарат көздерінен алынған.

Жалпы атаулар мен синонимдер 271 түрлі тілдерде және аймақтық варианттарда қол жетімді, олардың жалпы атауы бар түрлердің 85% -дан астамы қамтылған 21 тіл бар.

MyAvibase, 2013 жылы іске қосылған, оларды қолданғысы келетін пайдаланушыларға ақысыз құралдар ұсынады өмір тізімдері бақылаушы әлі көрмеген мақсатты түрлерді (қайда бару керек, нені көру керек, қашан бару керек, қанша уақыт болу керек) немесе жалпы аймақтық статистиканы (мысалы, түрлердің ел бойынша жалпы саны) табуға бағытталған есептер шығарыңыз.

Мәліметтер базасының ақпаратын қолдану

Avibase көптеген веб-сайттарда және рецензияланған басылымдарда бастапқы деректер ретінде қолданылады. Мысалы, ол көбінесе негізгі дереккөз ретінде қолданылады Википедия. Ол 600-ден астам жарияланымдарда келтірілген және оның деректері қолданылған,[12] әсіресе экология саласында,[13] сақтау,[14] паразитология,[15] адам денсаулығы,[16] таксономия[17][18] және биоинформатика.[19]

Авибаза идентификаторы құстардың ғылыми атауларындағы түсініксіз жағдайларды шешудің тәсілі ретінде қолданылады және оларды қабылдаған Солтүстік Америка құстарының AOS бақылау тізімі,[20] және олар қол жетімді Уикидеректер таксон жобасы.[21] Авибаза сонымен қатар, сияқты зерттеу топтарының таксономиялық ақпаратына сілтеме ретінде қолданылады Тұмауды зерттеу дерекқоры.

Ескертулер

  1. ^ «Деректер базасындағы» потенциалды таксондар «түсінігі.» Берендсон WG (1995) таксоны 44: 207–212.
  2. ^ «Таксономиялық ақпарат үшін стандартты деректер моделін ұсыну.» Кеннеди Дж, Хиам Р, Кукла Р, Патерсон Т (2006). OMICS: Интегративті биология журналы 10: 220–230.
  3. ^ «Avibase - таксономиялық тұжырымдамаларды басқару және ұйымдастырудың мәліметтер базасы жүйесі»., Lepage, Денис, Гаурав Вайдя және Роберт Гуралник, ZooKeys, 420 (2014 ж. 25 маусым): 117–35.
  4. ^ «Адамдарға немесе компьютерлерге арналған таксономия? Үлкен деректерге арналған когнитивті прагматика.» Штернер, Бекетт және Нико М.Франс. 2017. Биологиялық теория 12 (2): 99–111.
  5. ^ Сенімділікті арттыру үшін биоалуантүрлілік туралы жиынтық мәліметтер негізінде әлеуметтік дизайнды өзгертіңіз. Франц, Нико М. және Бекетт В.Штернер. 2018. Дерекқор 2018 (қаңтар).
  6. ^ «Таксономиялық айнымалыны бақылау: АҚШ-тың оңтүстік-шығыс гербарий порталы үшін таксономиялық тұжырымдаманың шешімі». Франц, Нико, Эдвард Гилберт, Бертрам Людшер және Алан Уакли. 2016. Зерттеу идеялары мен нәтижелері 2 (қыркүйек): e10610.
  7. ^ EBird / Clements әлем құстарының бақылау тізімі: v2019 Клементс, Дж.Ф., Т.С.Шуленберг, М.Дж.Илифф, С.М.Биллерман, Т.А.Фридрих, Б.Л.Салливан және К.Л.Вуд. 2019 ж.
  8. ^ Әлем құстарының анықтамалығы және BirdLife халықаралық әлем құстарының сандық тізімі. 4-нұсқа. HBW және BirdLife International (2019 ж. Желтоқсан)
  9. ^ ХОК Дүниежүзілік құстар тізімі (v10.1) Гилл Ф, Д Донскер және П Расмуссен (Eds). 2020.
  10. ^ Ховард және Мур әлем құстарының толық бақылау тізімі, 4.1 нұсқасы (жүктелетін бақылау тізімі) Кристидис және басқалар. 2018 жыл.
  11. ^ «Avibase - әлемдік құстар туралы мәліметтер базасы». avibase.bsc-eoc.org.
  12. ^ «Avibase - әлемдік құстар туралы мәліметтер базасы». avibase.bsc-eoc.org.
  13. ^ «Ғаламдық эволюциялық оқшаулау шаралары жақын маңдағы және неотропикалық құстар қауымдастығындағы негізгі жергілікті сақтау түрлерін ұстай алады». Реддинг, Дэвид В., Арне О. Моорс, Чаган Х. Шекерциоглу және Бен Коллен. 2015. Корольдік қоғамның философиялық операциялары В: Биологиялық ғылымдар 370 (1662): 20140013.
  14. ^ «Австралиядағы және Неотропикалық Америкадағы табиғатты сақтау: қиындықтарға тең ғылыми әлеуетті арттыру». Родригес, Джон Пол, Хавьер А. Симонетти, Андреа Премоли және Мигель Анжело Марини. 2005. Биологияның сақталуы 19 (3): 969-72.
  15. ^ «ДНҚ-ның метабаркодтауымен анықталған күтпеген құс қауырсындарының қауымдастығы динамикалық экоэволюциялық сценарийді ашады.» Донья, Хорхе, Дэвид Серрано, Сергей Миронов, Алисия Монтесинос ‐ Наварро және Роджер Джовани. 2019. Молекулалық экология 28 (2): 379–90.
  16. ^ «Адамның патогенділігі мен таралуының ғаламдық драйверлері». Данн, Роберт Р., Т. Джонатан Дэвис, Ниема С. Харрис және Майкл С. Гэвин. Корольдік қоғамның еңбектері B: Биологиялық ғылымдар 277 (1694): 2587–95.
  17. ^ «Консенсус жіктеліміне балама ретінде келіспеушілікті үйлестіру: био-онтологияға жүйелік түсініктемелер». Штернер, Бекетт, Джоери Виттевин және Нико Франц. 2020. Өмір туралы ғылым тарихы мен философиясы 42 (1): 8.
  18. ^ «Таксономияға плюрализм қажет, бірақ басқарылатын және басқарылатын».. Минелли, Алессандро. 2020. Мегатакса 1 (1): 9-18.
  19. ^ «Омыртқалы таксонның атауын ажыратуға арналған стандартталған анықтамалық деректер жиынтығы.» Зермоглио, Паула Ф., Роберт П. Гуралник және Джон Р. Вайцзорек. 2016. PLOS ONE 11 (1): e0146894.
  20. ^ «Солтүстік Америка құстарының тізімі (онлайн).» Чессер, Р. Т., К. Дж. Бернс, C. Цицерон, Дж. Л. Данн, А. В. Краттер, И. Дж. Ловетт, П. К. Расмуссен, Я. В. Ремсен, кіші, Д. Ф. Стотц және К. Винкер. 2019. Американдық орнитологиялық қоғам.
  21. ^ «Wikidata taxon жобасы».

Әдебиеттер тізімі

  • Митч, Лесли (2004), «Бүркіттер мен Торғайлар батыл болатын жерде», Ғылым, 304: 935, JSTOR  3836936
  • Бет, Денис; Вайдя, Гаурав; Гулралник, Роберт (2014), «Avibase - таксономиялық тұжырымдамаларды басқару мен ұйымдастырудың мәліметтер базасы жүйесі», ZooKeys (420): 117–135, дои:10.3897 / зоокейлер.420.7089, PMC  4109484, PMID  25061375
  • Дикинсон, Эдвард С. (2016), «Орнитологиялық номенклатураның негіздерін нығайту: Шерборн мен Ричмондтың библиографиялық барлаудың тарихи мұрасындағы олқылықтардың орнын толтыру.», ZooKeys (550): 107–134, дои:10.3897 / зоопарктер.550.9546, PMID  26877660
  • Вайдя, Гаурав; Бет, Денис; Гулралник, Роберт (2018), «таксономиялық түзету процесінің қарқыны мен режимі: таксономистер соңғы 127 жыл ішінде Солтүстік Америкадағы құс түрлерін қалай түзетіп, қалпына келтірді», PLOS One, 13 (4): e0195736, Бибкод:2018PLoSO..1395736V, дои:10.1371 / journal.pone.0195736, PMID  29672539

Сыртқы сілтемелер