CYB5R3 - CYB5R3 - Wikipedia

CYB5R3
Ақуыз CYB5R3 PDB 1ndh.png
Қол жетімді құрылымдар
PDBАдам UniProt іздеу: PDBe RCSB
Идентификаторлар
Бүркеншік аттарCYB5R3, B5R, DIA1, цитохром b5 редуктаза 3
Сыртқы жеке куәліктерOMIM: 613213 Ген-карталар: CYB5R3
Геннің орналасуы (адам)
22-хромосома (адам)
Хр.22-хромосома (адам)[1]
22-хромосома (адам)
CYB5R3 үшін геномдық орналасу
CYB5R3 үшін геномдық орналасу
Топ22q13.2Бастау42,617,840 bp[1]
Соңы42,649,392 bp[1]
РНҚ экспрессиясы өрнек
PBB GE CYB5R3 201885 s at fs.png
Қосымша сілтеме өрнегі туралы деректер
Ортологтар
ТүрлерАдамТышқан
Энтрез
Ансамбль
UniProt
RefSeq (mRNA)

NM_007326
NM_000398
NM_001129819
NM_001171660
NM_001171661

жоқ

RefSeq (ақуыз)

NP_000389
NP_001123291
NP_001165131
NP_001165132
NP_015565

жоқ

Орналасқан жері (UCSC)Хр 22: 42.62 - 42.65 Mbжоқ
PubMed іздеу[2]жоқ
Уикидеректер
Адамды қарау / өңдеу

NADH-цитохром b5 редуктаза 3 болып табылады фермент адамдарда кодталған CYB5R3 ген.[3][4]

Құрылым

CYB5R3 гені 22-ші хромосомада орналасқан, оның нақты орналасуы 22q13.2. Генде 12 бар экзондар.[5] CYB5R3 301 амин қышқылынан тұратын 34,2 кДа ақуызды кодтайды; 63 пептидтер байқалды масс-спектрометрия деректер.[6][7]

Барлық геннің ұзындығы шамамен 31 кб. 2 экзонында мембранамен байланысатын домен мен b5R каталитикалық аймағының түйісуі бар, бұл b5R екі формасы бар екенін көрсетеді: еритін форма және мембранамен байланысқан форма. Бұл геннің 5 'бөлігі типтік реттеуші транскрипциялық элементтерге ие емес, бірақ G-G-G-C-G-G тізбегіне барлығы бес рет ие. Геннің осы 5 'бөлігінің GC мөлшері 86% құрайды, бұл бүкіл геннің орташа GC-нен едәуір жоғары, бұл 55%. Сондай-ақ, геннің 3'-аударылмаған аймағында типтік емес полиаденилдену сигналы бар.[3]

CYB5R3 генімен кодталған ақуыз цитохром b5 редуктаза, а флавопротеин әртүрлі локализациясы бар екі түрлі изоформалар түрінде шығарылады. Эритроциттерден басқа барлық жасуша типтерінде кездесетін амфифатикалық микросомалық изоформ бар; бұл изоформаның біреуі бар гидрофобты якорьды мембраналық домен және бір каталитикалық домен гидрофильді. Басқа изоформасы, еритін цитохром b5 редуктаза изоформасы, адамның эритроциттерінде кездеседі. Бұл ақуыз қысқартылған және тек үлкен, гидрофильді домен шығаратын балама транскриптпен кодталған.[8] Ақуызда 4 цистеин қалдықтары бар, Cys-203, -273, -283, -297. Cys-283 химиялық модификация арқылы NADH байланыстыруға қатысады деп саналады; іс жүзінде Cys-273 және Cys-283 екеуі де NADH байланыстыратын жерге жақын деп саналады.[9] Мембранамен байланысатын доменнің NH2-терминал құрылымы CH3 (CH2) 12-CO-Gly-Ala-Gln-Leu-Ser-Thr-Leu-Gly-His-Met-Val-Leu-Phe-Pro-Val- Trp-Phe-Leu-Tyr-Ser-Leu-Leu-Met-Lys.[10]

NADH-цитохром b5 редуктазаның екі формасы белгілі, олар мембранамен байланысқан соматикалық жасушалар (зәкірлі эндоплазмалық тор, митохондрия және басқа мембраналар) және еритін форма эритроциттер. Мембранамен байланысқан форманың мембранамен байланыстырушы және каталитикалық домендері болады. Еритін формада тек каталитикалық домен болады. Бұл ген бірінші экзонмен ерекшеленетін тіндерге тән альтернативті транскрипциялардан пайда болатын ферменттің екі формасын да кодтайды. Бұл геннің мутациясы метгемоглобинемияны тудырады.[5]

Функция

Цитохром b5 редуктазы қалпына келтіруші эквиваленттерді фадиологиялық электрон доноры NADH-дан FAD домені арқылы цитохром b5 кішігірім молекулаларына өткізуге қатысады. Бұл сонымен қатар көпшілікке қатты қатысты тотығу және метемоглобиннің гемоглобинге дейін тотықсыздануы сияқты тотықсыздану реакциялары.[8] NADH-цитохромы b5 редуктазаның екі формасының ішіндегі мембранамен байланысқан форма негізінен эндоплазмалық тордың цитоплазмалық жағында болады және десатурация мен созылу функцияларын орындайды. май қышқылдары, холестерин биосинтезінде және дәрілік зат алмасуда. Эритроциттер формасы айналымдағы эритроциттердің еритін фракциясында орналасқан және қатысады метгемоглобин төмендету.[5]

Клиникалық маңызы

CYB5R3 генінің мутациясы метемоглобинемияның I және II типтерін тудырады. Бұл NADH-цитохром b5 редуктаза изоформасының жетіспеуіне байланысты сирек кездесетін аутосомды-рецессивті ауру.[11] Осы геннің көптеген мутациясы және аурудың кейінгі көрінісі сипатталған.[12] Ауру адамда тотыққан Fe + 3 жинақталуымен көрінеді.[8] І типті рецессивті туа біткен метгемоглобинемия (RCM) еритін изоформаның жетіспеушілігімен сипатталады және тері мен шырышты қабаттардың цианозы түрінде көрінеді.[13] II типтегі ақау екі изоформаға да әсер етеді және осылайша эритроциттер, лейкоциттер және дененің барлық тіндері сияқты жалпы тіндерге әсер етеді. Бұл тип ақыл-ой жетіспеушілігімен және басқа неврологиялық симптомдармен байланысты, себебі бұл b5 цитохромы жүйесі организмдегі май қышқылдарының десатурациясында шешуші рөл атқарады.[14] Бір пациент осы бұзылыстың III типті жаңа класы бар деп сипатталды. Бұл жағдай лимфоциттерде, тромбоциттерде және эритроциттерде NADH цитохромы b5 редуктаза тапшылығымен сипатталды, бірақ бұл ақыл-ойдың артта қалуымен байланысты емес еді.[15]

Өзара әрекеттесу

CYB5R3 өзара әрекеттесетіні белгілі CYB5A, ENO1, және SUMO2 басқа белоктар арасында.[5]

Әдебиеттер тізімі

  1. ^ а б в GRCh38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSG00000100243 - Ансамбль, Мамыр 2017
  2. ^ «Адамның PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
  3. ^ а б Tomatsu S, Kobayashi Y, Fukumaki Y, Yubisui T, Orii T, Sakaki Y (тамыз 1989). «Адамның NADH-цитохромы b5 редуктаза генінің ұйымдастырылуы және толық нуклеотидтік реттілігі». Джин. 80 (2): 353–61. дои:10.1016/0378-1119(89)90299-0. PMID  2479590.
  4. ^ Bull PC, Shephard EA, Povey S, Santisteban I, Phillips IR (қазан 1988). «Адамның цитохромы b5 редуктазасын клондау және хромосомалық картаға түсіру (DIA1)». Адам генетикасының жылнамалары. 52 (Pt 4): 263-8. дои:10.1111 / j.1469-1809.1988.tb01105.x. PMID  3268037.
  5. ^ а б в г. «Entrez Gene: CYB5R3 цитохромы b5 редуктазы 3».
  6. ^ Zong NC, Li H, Li H, Lam MP, Jimenez RC, Kim CS, Deng N, Kim AK, Choi JH, Zelaya I, Liem D, Meyer D, Odeberg J, Fang C, Lu HJ, Xu T, Weiss J , Дуан Х, Ухлен М, Йейтс Дж.Р., Апвейлер Р, Ге Дж, Гермякоб Н, Пинг П (қазан 2013). «Жүрек протеомдарының биологиясы мен медицинасын мамандандырылған білім қорымен интеграциялау». Айналымды зерттеу. 113 (9): 1043–53. дои:10.1161 / CIRCRESAHA.113.301151. PMC  4076475. PMID  23965338.
  7. ^ «NADH-цитохром b5 редуктаза 3». Атлас жүрек ақуыздары туралы білім қоры (COPaKB).[тұрақты өлі сілтеме ]
  8. ^ а б в Elahian F, Sepehrizadeh Z, Moghimi B, Mirzaei SA (маусым 2014). «Адамның цитохромы b5 редуктаза: құрылымы, қызметі және әлеуетті қолданылуы». Биотехнологиядағы сыни шолулар. 34 (2): 134–43. дои:10.3109/07388551.2012.732031. PMID  23113554.
  9. ^ Ширабе К, Юбисуи Т, Нишино Т, Такешита М (сәуір 1991). «Учаске бағытталған мутагенез арқылы зерттелген адамның NADH-цитохромы-редуктазадағы цистеин қалдықтарының рөлі. Cys-273 және Cys-283 NADH байланыстыратын жерге жақын орналасқан, бірақ каталитикалық маңызды емес». Биологиялық химия журналы. 266 (12): 7531–6. PMID  2019583.
  10. ^ Мураками К, Юбисуи Т, Такешита М, Мията Т (ақпан 1989). «Адам және егеуқұйрық бауыр микросомалық NADH-цитохром b5 редуктазаларының NH2-терминалдық құрылымдары». Биохимия журналы. 105 (2): 312–7. дои:10.1093 / oxfordjournals.jbchem.a122659. PMID  2498303.
  11. ^ Галеева Н.М., Ненашева С.А., Клеменова И.С., Поляков А.В. (қараша 2012). «[Тұқым қуалайтын метгемоглобинемиямен ауыратын науқастардан алынған CYB5R3 геніндегі үлкен көлемді жою c.22-1320_633 + 1224del]». Генетика. 48 (11): 1336–46. PMID  23297489.
  12. ^ Fermo E, Bianchi P, Vercellati C, Marcello AP, Garatti M, Marangoni O, Barcellini W, Zanella A (2008). «Рецессивті тұқым қуалайтын метгемоглобинемия: NADH-цитохром b5 редуктаза геніндегі екі жаңа мутация». Қан жасушалары, молекулалар және аурулар. 41 (1): 50–5. дои:10.1016 / j.bcmd.2008.02.002. PMID  18343696.
  13. ^ Галеева Н.М., Воевода М.И., Спиридонова М.Г., Степанов В.А., Поляков А.В. (2013 ж. Сәуір). «[Якутиядағы рецессивті туа біткен метгемоглобинемияның себебі ретінде CYB5R3 геніндегі популяция жиілігі және c.806C> T мутациясы]». Генетика. 49 (4): 523–30. дои:10.7868 / s0016675813030065. PMID  23866629.
  14. ^ Хадспет МП, Джозеф С, Холден КР (қаңтар 2010). «II типті метгемоглобинемияның жаңа мутациясы». Балалар неврологиясы журналы. 25 (1): 91–3. дои:10.1177/0883073809336136. PMID  19471045.
  15. ^ Нагай Т, Ширабе К, Юбисуи Т, Такешита М (ақпан 1993). «Мутантты NADH-цитохром b5 редуктаза анализі: айқын» типті «метгемоглобинемия тұрақсыз редуктаза бар I тип деп түсіндіруге болады». Қан. 81 (3): 808–14. дои:10.1182 / blood.V81.3.808.bloodjournal813808. PMID  8427971.

Сыртқы сілтемелер

Әрі қарай оқу