D-стереоспецификалық аминопептидаза - D-stereospecific aminopeptidase
| D-аминопептидаза, B домені | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 окробактрум антропиясынан алынған d-аминопептидазаның кристалдық құрылымы | |||||||||
| Идентификаторлар | |||||||||
| Таңба | DAP_B | ||||||||
| Pfam | PF07930 | ||||||||
| Pfam ру | CL0013 | ||||||||
| InterPro | IPR012856 | ||||||||
| SCOP2 | 1эи5 / Ауқымы / SUPFAM | ||||||||
| |||||||||
| D-аминопептидаза, домен С | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
окробактрум антропиясынан алынған d-аминопептидазаның кристалдық құрылымы | |||||||||
| Идентификаторлар | |||||||||
| Таңба | DAP_C | ||||||||
| Pfam | PF07932 | ||||||||
| InterPro | IPR012857 | ||||||||
| SCOP2 | 1эи5 / Ауқымы / SUPFAM | ||||||||
| |||||||||
Молекулалық биологияда, D-стереоспецификалық аминопептидаза (D-аминопептидаза) EC 3.4.11.19 болып табылады фермент қайсысы катализдер босату N-терминал D-аминқышқылы а пептид, Xaa жақсырақ болатын Xaa- | -Yaa- D-Ала, D-Ser немесе D-Thr. D-амин қышқылы амидтері мен метил эфирлері, сондай-ақ глицин амиди гидролизденеді.
Бұл dimeric әрқайсысымен бірге фермент мономер үшеуінен тұрады домендер. B домені а қалыптастыру үшін ұйымдастырылған бета баррель сегізден тұрады антипараллель бета жолдары. Ол сегіз қалдық тізбегі арқылы, сонымен қатар А доменімен, каталитикалық доменмен байланысты өзара әрекеттеседі екеуімен де домендер А және С арқылы ковалентті емес облигациялар. B домені, мүмкін, C доменін жақсы жағдайда ұстауда өзара әрекеттесу каталитикалық доменмен[1] C домені а қалыптастыру үшін ұйымдастырылған бета баррель сегіз антипараллельден тұрады бета жолдары. Ол B доменіне қысқа сілтеме тізбегі арқылы, және өзара әрекеттеседі кеңейтілген А доменімен, каталитикалық доменмен. Гамма цикл домен С каталитикалық қалта қабырғасының бір бөлігін құрайды; C домені шынымен беріледі деп есептеледі субстрат және ингибитор ферменттің ерекшелігі.
Сыртқы сілтемелер
Әдебиеттер тізімі
- ^ Bompard-Gilles C, Remaut H, Villeret V, Prange T, Fanuel L, Delmarcelle M, Joris B, Frere J, Van Beeumen J (қыркүйек 2000). «Ochrobactrum антропиясының D-аминопептидазасының кристалдық құрылымы,» пенициллинді танитын ферменттер «отбасының жаңа мүшесі». Құрылым. 8 (9): 971–80. дои:10.1016 / S0969-2126 (00) 00188-X. PMID 10986464.
