Флуоресценцияны белсендіретін және сіңіруді ауыстыратын тег - Fluorescence-activating and absorption-shifting tag - Wikipedia

ТЕЗ (Флуоресценцияны белсендіретін және сіңіруді ауыстыратын тег) кішкентай, генетикалық кодталған, ақуыз тегі бұл қызығушылық тудыратын ақуыздар туралы флуоресценттік есеп беруге мүмкіндік береді. Табиғи люминесцентті ақуыздардан және GFP немесе mCherry сияқты туындылардан айырмашылығы, FAST өздігінен флуоресцентті емес. Ол 4-гидроксибензилиден роданиннен (HBR) алынған флуорогенді хромофорды таңдамалы түрде байланыстыра алады, ол байланыспаса, флуоресцентті емес. Бір-біріне байланған молекулалар жұбы екі спектроскопиялық өзгеріске, флуоресценттік кванттық кірістіліктің жоғарылауына және абсорбцияның қызыл ығысуына негізделген флюорогенді активтендірудің ерекше механизмінен өтеді, сондықтан таңбалаудың жоғары таңдамалылығын қамтамасыз етеді. FAST-флуорогенді есеп беру жүйесін флуоресценттік микроскопияда, ағындық цитометрияда және кез-келген басқа флюорометриялық әдіспен тірі әлемді зерттеу үшін қолдануға болады: биосенсорлар, белоктар айналымы.

FAST, кішкене 14 кДа ақуыз, фото эволюциялық сары ақуыздан (PYP) бағытталған эволюция арқылы жасалды. Бұл туралы алғаш рет 2016 жылы зерттеушілер хабарлады Ecole normale supérieure de Paris.[1]

Механизм

FAST ақуыздарды арнайы таңбалаудың химиялық-генетикалық стратегиясына жатады. «Тег» деп аталатын пептидтік домен генетикалық тұрғыдан қызығушылық ақуызымен байланысады (олардың трансфекциясы немесе инфекциясы арқылы тиісті гендерін біріктіру арқылы). Бұл тег синтетикалық флуоресцентті зондтың қосымша қосылатын зәкірі болып табылады.[2] Мұндай химиялық-генетикалық тәсіл, мысалы, табиғи флуоресцентті ақуыздардан басқа жүзеге асырылды GFP немесе олардың туындылары mCherry қазірдің өзінде кеңінен қолданылатын бірнеше жүйелерде:

  • 2003 жылдан бастап, SNAP-тег, адам ферментінен алынған 19 кДа пептидтен тұратын екі компонентті есеп беру жүйесі, O6-метилгуанин-АДН метилтрансфераза, флуоресцентті ковалентті байланыс түзіп дамыды O6-бензилгуанин туындылары; SNAP-тег кейінірек ортогоналды тегке айналды, CLIP-тег;
  • 2008 жылдан бастап, HaloTag, бактериялық ферменттен алынған 33 кДа пептидтен тұратын екі компонентті есеп беру жүйесі, галоалкан десалогеназ, ол арнайы галогенденген синтетикалық лигандтарды байланыстыра алады, көбінесе жасушаларды бейнелеу үшін флуоресцентті (мысалы, Кумарайн, Орегон Грині, Alexa Fluor 488, diAcFAM, TMR).
FAST пен фтороген арасындағы қайтымды байланыс

FAST-тің бірнеше нұсқалары аз мөлшердегі мутациялармен ерекшеленетін сипатталған, мысалы, FAST1 (a-k.a. Y-FAST), FAST2 (aFA.a. iFAST), немесе dimer, td-FAST.[3] Сондай-ақ, ақуыз бен ақуыздың өзара әрекеттесуін бақылауға арналған, splitFAST комплементациялы сплит нұсқасы жасалды.[4] FAST немесе splitFAST гендерін көрсететін бірқатар плазмидалар Адгенде бар.[5]

Қолданбалар

FAST-фторогенді есеп беру жүйесі қолданылады флуоресценттік микроскопия, ағындық цитометрия және тірі әлемді зерттеудің кез-келген басқа флюорометриялық әдістері, соның ішінде биосенсорлар және ақуыз айналымы. FAST биофильмдерді динамикалық суретке түсіруге арналған, себебі оның аз оттегі жағдайында флуоресценцияның ерекше қабілеті бар.[6] Сол себепті анаэробтарды бейнелеу мен FACSing жасауға мүмкіндік береді, мысалы Клостридий сияқты биомасса ашыту үшін қолданылады ABE ашыту.[7] FAST туралы хабарланды супер ажыратымдылықтағы микроскопия тірі жасушалардың.[8]

FAST және оның туындылары үшін флюорогендер шығарылды, олардың толқынды ұзындығына, жарықтығына және тегінің жақындығына байланысты әр түрлі болады. Кейбіреулері өтпейтін, яғни, олар жасушалық мембраналардан өте алмайды, сондықтан мембраналық ақуыздарды немесе жасушадан тыс ақуыздарды таңбалау, мысалы, сатылымды синтезден шығарылғанға дейін бақылау.[9]

Әдебиеттер тізімі

  1. ^ Пламонт, Мари-Оде; Биллон-Денис, Эммануэль; Маурин, Сильви; Гаурон, Кароле; Пимента, Фредерико М .; Спект, Кристиан Г .; Ши, Цзянь; Керар, Жером; Пан, Буян; Россниголь, Джулиен; Монкок, Карине (2015-12-28). «In vivo-да реттелетін ақуызды бейнелеу үшін флуоресценцияны белсендіретін және сіңіруді ауыстыратын шағын белгі». Ұлттық ғылым академиясының материалдары. 113 (3): 497–502. дои:10.1073 / pnas.1513094113. ISSN  0027-8424. PMC  4725535. PMID  26711992.
  2. ^ Пламонт, Мари-Оде; Биллон-Денис, Эммануэль; Маурин, Сильви; Гаурон, Кароле; Пимента, Фредерико М .; Спект, Кристиан Г .; Ши, Цзянь; Керар, Жером; Пан, Буян; Россниголь, Джулиен; Монкок, Карине (2016-01-19). «In vivo-да реттелетін ақуызды бейнелеу үшін флуоресценцияны белсендіретін және сіңіруді ауыстыратын шағын белгі». Ұлттық ғылым академиясының материалдары. 113 (3): 497–502. Бибкод:2016PNAS..113..497P. дои:10.1073 / pnas.1513094113. ISSN  0027-8424. PMC  4725535. PMID  26711992.
  3. ^ Тебо, Элисон Г .; Пимента, Фредерико М .; Чжан, Ю; Готье, Арно (2018-10-02). «Тірі жасуша микроскопиясына арналған жетілдірілген химиялық-генетикалық флуоресцентті маркерлер» (PDF). Биохимия. 57 (39): 5648–5653. дои:10.1021 / acs.biochem.8b00649. ISSN  0006-2960. PMID  30204425.
  4. ^ Тебо, Элисон Г .; Готье, Арно (2019-08-14). «Авторлық түзету: тез және қайтымды комплементациямен бөлінген люминесценттік репортер». Табиғат байланысы. 10 (1): 3730. Бибкод:2019NatCo..10.3730T. дои:10.1038 / s41467-019-11689-6. ISSN  2041-1723. PMC  6694131. PMID  31413330.
  5. ^ «Адген: Арно Готье зертханасының плазмидалары». www.addgene.org. Алынған 2019-11-25.
  6. ^ Монмейран, Амаури; Томен, Филипп; Джонкьере, Уго; Бюро, Франк; Ли, Ченге; Пламонт, Мари-Оде; Дуарше, Карин; Каселла, Жан-Франсуа; Готье, Арно; Генри, Нелли (2018-07-09). «Индустирленген химиялық-генетикалық флуоресцентті маркер бактериялық биофильм динамикасының сандық есебінде классикалық флуоресцентті белоктардан асып түседі». Ғылыми баяндамалар. 8 (1): 10336. Бибкод:2018 жыл НАТСР ... 810336M. дои:10.1038 / s41598-018-28643-z. ISSN  2045-2322. PMC  6037777. PMID  29985417.
  7. ^ Чарубин, Камил; Беннетт, Р.Кайл; Тез, Алан Г. Папаутсакис, Элефтериос Т. (қараша 2018). «Микробтық жасуша фабрикасы ретіндегі клостридий организмдерін құру: қиындықтар мен мүмкіндіктер». Метаболиттік инженерия. 50: 173–191. дои:10.1016 / j.ymben.2018.07.012. ISSN  1096-7176. PMID  30055325.
  8. ^ Венкатахалапапатия, Мутукумаран; Белапуркар, Вивек; Хосе, Мини; Готье, Арно; Nair, Deepak (2019). «Флуорогенді байланыстыратын белгілерді қолдана отырып радиалды тербелістер арқылы жасушаларды супер ажыратымдылықпен бейнелеу». Наноөлшем. 11 (8): 3626–3632. дои:10.1039 / c8nr07809b. ISSN  2040-3364. PMID  30734810.
  9. ^ Ли, Ченге; Муртон, Орелиен; Пламонт, Мари-Оде; Родригес, Ванесса; Аужар, Изабель; Волович, Мишель; Le Saux, Thomas; Перес, Франк; Вриз, Софи; Джуллиен, Людович; Джолиот, Ален (2018-06-20). «Мембраналық ақуыздар айналымының флуорогендік зондтауы» (PDF). Биоконцентті химия. 29 (6): 1823–1828. дои:10.1021 / acs.bioconjchem.8b00180. ISSN  1043-1802. PMID  29791141.