Бұршақ тұқымдастар лектиндер отбасы - Leguminous lectin family

Lectin_legB
PDB 1rin EBI.jpg
бұршақ лектин-триманнозидтік кешенінің рентгендік кристалды құрылымы, 2,6 ангстремдік рұқсатта
Идентификаторлар
ТаңбаLectin_legB
PfamPF00139
Pfam руCL0004
InterProIPR001220
PROSITEPDOC00278
SCOP21лем / Ауқымы / SUPFAM

Молекулалық биологияда бұршақ тұқымдастар лектиндер отбасы Бұл отбасы туралы дәріс белоктар.

Бұл ең үлкендердің бірі дәріс 70-тен астам лекторы бар отбасылар 1990 жылы шолуда баяндама жасады.[1] Бұршақ тұқымдас лектиндер екі немесе төртеуінен тұрады бөлімшелер, әрқайсысында бір көмірсумен байланысатын учаске бар. -Мен өзара әрекеттесу қанттар тығыз байланыстыруды қажет етеді кальций және марганец иондар. Осы дәрістердің құрылымдық ұқсастығы туралы алғашқы құрылымдық талдаулар және Рентген-кристаллографиялық зерттеу.[2][3] Рентгенологиялық зерттеулер көрсеткендей бүктеу туралы полипептид көмірсулармен байланысатын учаскелер аймағындағы тізбектер де біріншілік айырмашылықтарына қарамастан ұқсас тізбектер. Бұл лектиндердің көмірсулармен байланысатын учаскелері екіден тұрады сақталған аминқышқылдары қосулы бета бүктелген парақтар. Осы ілмектердің біреуі бар өтпелі металдар, кальций мен марганец амин қышқылы қантпен байланыстыратын учаскенің қажетті орындардағы қалдықтары. Аминқышқылдарының бірізділігі бұл цикл осы лектиндердің көмірсулармен байланысу ерекшеліктерінде маңызды рөл атқарады. Бұл дәрістер байланыстыру немесе глюкоза, маноз немесе галактоза. Нақты функциясы бұршақ лекиндер белгісіз, бірақ олардың қосылуына қатысуы мүмкін азотты бекіту бактериялар бұршақ тұқымдастарға және одан қорғауға арналған патогендер.[4][5]

Кейбір бұршақ тұқымдас дәрістер протеолитикалық екі тізбек шығару үшін өңделген, бета (ол сәйкес келеді N-терминал ) және альфа (C-терминалы ). Лектор конканавалин А (conA) бастап бұршақ екі тізбектің болуымен ерекше ауыстырылды және байланған (жаңасын құру арқылы) пептид байланыс). Жетілген конА-ның N терминалы альфа тізбегіне, ал C бета тізбегіне сәйкес келеді.[6]

Әдебиеттер тізімі

  1. ^ Шарон Н, Лис Н (1990). «Бұршақ лектиндері - гомологты ақуыздардың үлкен отбасы». FASEB J. 4 (14): 3198–208. дои:10.1096 / fasebj.4.14.2227211. PMID  2227211.
  2. ^ de Oliveira TM, Delatorre P, da Rocha BA, de Souza EP, Nascimento KS, Bezerra GA және т.б. (2008). «Dioclea rostrata lektin кристалды құрылымы: рН-қа тәуелді димер-тетрамер тепе-теңдігін түсіну және Diocleinae лектиндеріндегі көмірсуларды танудың құрылымдық негіздері». J Struct Biol. 164 (2): 177–82. дои:10.1016 / j.jsb.2008.05.012. PMID  18682294.
  3. ^ Розварски Д.А., Свами Б.М., Брювер СФ, Сачеттини JC (1998). «Dioclea grandiflora-дан алынған лектиннің құрылымы аспарагинді көмірсулардың негізгі триманнозидімен кешенделген». J Biol Chem. 273 (49): 32818–25. дои:10.1074 / jbc.273.49.32818. PMID  9830028.
  4. ^ Roopashree S, Singh SA, Gowda LR, Rao AG (2006). «Өсімдікті қорғаудағы екі функционалды ақуыз: Долихос бифлорынан алынған тұқым лектоны (жылқы грамы) липоксигеназаның белсенділігін көрсетеді». Биохим Дж. 395 (3): 629–39. дои:10.1042 / BJ20051889. PMC  1462680. PMID  16441240.
  5. ^ Берингер Дж.Е., Брюин Н, Джонстон А.В., Шульман Х.М., Хопвуд Д.А. (1979). «Ризобиум - бұршақ тұқымдастар симбиозы». Proc R Soc Lond B Biol Sci. 204 (1155): 219–33. дои:10.1098 / rspb.1979.0024. PMID  36624. S2CID  24965697.
  6. ^ Carrington DM, Auffret A, Hanke DE (1985). «Полипептидті байлау конканавалин А-ның трансляциядан кейінгі модификациясы кезінде пайда болады». Табиғат. 313 (5997): 64–7. дои:10.1038 / 313064a0. PMID  3965973. S2CID  4359482.
Бұл мақалада көпшілікке арналған мәтін енгізілген Pfam және InterPro: IPR001220