Маккензи Вейгандт Матис - Mackenzie Weygandt Mathis

Mackenzie W. Mathis, американдық нейробиолог және негізгі тергеуші École Polytechnique Fédérale de Lozanne. Оның зертханасы неврологиялық аурулардағы болашақ трансляциялық зерттеулер туралы ақпарат беру үшін тышқандардағы адаптивті қозғалтқыштық мінез-құлықтың жүйке негіздерін зерттейді.

Mackenzie W. Mathis
ҰлтыАмерикандық
Алма матерОрегон университеті, Гарвард университеті
БелгіліЖануарлардың позаларын бағалауға арналған DeepLabCut терең оқыту бағдарламасы
МарапаттарГарвард Роулэнд стипендиаты, ELLIS қоғамының стипендиаты, Бертарелли қорының интегративті неврология ғылымдарының төрағасы
Ғылыми мансап
ӨрістерНеврология
МекемелерÉcole Polytechnique Fédérale de Lozanne
Веб-сайтhttp://www.mousemotorlab.org

Ерте өмірі және білімі

Матис өзінің бакалавриатта білім алған Орегон университеті 2007 жылы ғылым бакалаврларын қабылдау.[1] Содан кейін ол аға ғылыми-техникалық қызметкер және Project A.L.S. зертханасының меңгерушісі болып жұмыс істеді. Сабақ жасушаларын зерттеу зертханасы Колумбия университеті 2007 жылдан 2012 жылға дейін.[1][2] Доктор Кристофер Э. Хендерсон мен доктордың жетекшілігімен жұмыс жасау. Хайнек Вичтерле, Mathis моделін жасады бүйірлік амиотрофиялық склероз (A.L.S.) пайдалану бағаналы жасуша - қозғалмалы нейрондар.[2] Лабораторияда жұмыс істеген уақытында ол екі алғашқы авторлық ғылыми мақалаларын, біреуін ғылыми мақалаларын жариялады Неврология журналы неврологиялық ауруларды зерттеу үшін in vitro адамның аяқ-қолын нервтендіретін жүйке подтиптерін генерациялаудың жаңа хаттамасын ұсынды,[3] және екіншісі Табиғи биотехнология iPS діңгекті жасушалық сызықтардың қозғалтқыш нейрондарын жасау қабілетін салыстыру[4]. Содан кейін Матис Бостонға көшіп келіп, молекулалық және жасушалық биология (MCB) магистратурасына қосылды Гарвард университеті.[5] PhD докторантурасын аяқтау жолында ол магистратураны да аяқтады.[1][5] PhD докторы кезінде Матис профессордың тәлімгерлігімен марапаттауды болжау қателіктеріне негізделген жүйке тізбектері бойынша зерттеулер жүргізді. Наошиге Учида Гарвард миы туралы ғылым орталығында.[5] Аспирантурада оқитын бірінші жылы Матис ан Ұлттық ғылыми қордың стипендиясы оның дипломдық жұмысын қаржыландыру.[6] Матис қозғалтқышты басқарудағы қызығушылықтарын Учиданың жүйке жазбалары мен мінез-құлық талдауындағы тәжірибесімен зертханада жаңа ғылыми бағыт қалыптастыру үшін біріктіре алды.[5] және алғашқы авторлық мақаланы жариялау Нейрон PhD докторантурасының аяғында маңызды рөл атқарды соматосенсорлы қыртыс алдыңғы қатарда қозғалтқышты бейімдеу кеміргіштерде.[7] PhD докторы Мэтиске Роуленд стипендиясы тағайындалды, ол Гарвардтың Кембридждегі Роуленд Институтында өзінің зертханасын ашуға бес жыл бойы қаржы бөлді, MA.[5] Гарвардта математика зертханасын құрмас бұрын, Матиске де марапатталған Әйелдер мен ми (WATB) оған жұмыс істеуге қаражат бөлген ми саласындағы ғылымды дамыту стипендиясы Германия профессордың жетекшілігімен Матиас Бетге кезінде Тюбинген университеті.[5] Докторантурадан кейінгі жұмысында Матис ізашарлық қызметке баса назар аударды терең оқыту оның тәуелсіз мансабына маңызды қадам болған жүйке және мінез-құлықты талдау құралдары.[8]

Мансап және зерттеу

2017 жылы Матис өзінің зертханасын басталды Роулэнд институты кезінде Гарвард университеті адаптивті қозғалтқышты басқаратын жүйенің кері инженерлік тізбегінің мақсаты.[5] Кең ауқымды жүйке жазбалары және жаңа роботтандырылған және машиналық оқыту құралдары арқылы Матис зертханасы ми функциясының мінез-құлықпен байланысын жақсы түсіну үшін жүйке тізбектерін зерттейді және мінез-құлық нәтижелерін талдайды.[9] Mathis тұжырымдамасына арналған ашық ғылым[10] және сол сияқты, роман терең оқыту докторымен бірлесе отырып жасаған ол құралды. Александр Матис, болып табылады ашық қол жетімділік нейрондық белсенділіктің белгілі бір мінез-құлықты қалай қоздыратынын жақсы түсіну үшін жануарлардың мінез-құлқын әділ және нақты түрде талдау үшін осы құралды пайдалану үшін бүкіл әлем зерттеушілері кодқа қол жеткізе алады.[10][11][12] Матис ойлап тапқан терең оқыту құралы деп аталады DeepLabCut[13] сүйенеді ауыстырып оқыту бар дайындалғанды ​​оңтайландыру нейрондық желі жеткілікті дайындықтан кейін қажетті жаңа мәліметтер базасына.[12] Mathis бұл құралдың жан-жақтылығын көптеген әр түрлі мәліметтер жиынтығында неврологиядан тыс жерлерде де кеңінен қолдану үшін сенімді дизайн мен әлеуетті көрсететін көрсетті.[14] Оның жұмысы Табиғатта,[15] Bloomberg іскери апталығы[16]және Атлантика.[17]

2020 жылдың тамыз айынан бастап Матис көшті Швейцария Федералды Технологиялық Институты Brain Mind Institute & Neuroprosthetics орталығында профессор ретінде жұмыс істейді.[18][19] Зертхана орналасқан Биотехникалық кампус жылы Женева, Швейцария, онда Матис Бертарелли қорының интегративті неврология кафедрасын басқарады.[20][19]

Марапаттар мен марапаттар

  • 2019 - 2020 ғылымға арналған CZI Essential ашық бастапқы бағдарламалық жасақтамасы - DeepLabCut гранты[21]
  • 2019 ELLIS қоғамының стипендиаты, табиғи интеллект[1]
  • 2018 Гарвард университетінің ақыл-ой, ми және мінез-құлық факультеті сыйлығы
  • 2018 eLife Travel грантының иегері[22]
  • 2017 NVIDIA GPU гранты[20]
  • 2017 - 2022 Роуленд стипендиясы[5]
  • 2017 әйелдер және неврологияны дамыту үшін ми стипендиясы[23]
  • 2013 - 2018 Ұлттық ғылым қоры Жоғары ғылыми стипендия Өмір туралы ғылымдар - неврология[6]
  • 2013, '14, '16 Гарвард университетінің оқытудағы айрықша сертификаты (MCB80, MCB145)[24]
  • Доктор Эрнест Перальта қоры, Гарвард, «Үздік біліктілік емтиханы бойынша ұсыныс және қорғаныс» сыйлығы[18][25]
  • 2012 - 2013 Моррис Э. Зукерманның стипендиясы - Гарвард GSAS-да ми ғылымдарының үздік студенттеріне беріледі[18]

Жарияланымдар

[26]

  • Мэтис, М.В., & Mathis, A. (2020). Неврологиядағы жануарлардың мінез-құлқын өлшеуге арналған терең оқыту құралдары. Нейробиологиядағы қазіргі пікір, 60, 1-11.
  • Mathis, A., Yüksekgönül, M., Rogers, B., Betge, M., & Мэтис, М.В. (2019). Алдын ала тергеу позаны бағалау үшін доменнен тыс сенімділікті арттырады. ArXiv, абс / 1909.11229.
  • Натх, Т., Мэтис, А., Чен, А.С., Пател, А., Бетге, М., & Мэтис, М.В. (2019). DeepLabCut-ті түрлер мен мінез-құлық бойынша 3D маркерсіз позаны бағалау үшін пайдалану. Табиғат хаттамалары, 14, 2152-2176.
  • Матис, А., Мамиданна, П., Кюри, К.М., Абэ, Т., Мерти, В.Н., Мэтис, М.В. *, & Bethge, M. * (2018). DeepLabCut: терең оқыта отырып, пайдаланушы анықтаған дене мүшелерін маркерсіз позамен бағалау. Табиғат неврологиясы, 21, 1281-1289. * тең авторлар
  • Mathis MW, Mathis A, Uchida N. Somatosensory Cortex тышқандардағы алдыңғы қозғалтқыш адаптациясында маңызды рөл атқарады, Нейрон. 2017. 10.1016 / j.neuron.2017.02.049.
  • Ho R, Sances S, G Gelling, Аморозо, МВт, т.б. ALS омыртқа моторы нейронының жетілуін және гендердің экспрессиялық желілеріндегі қартаю жолдарын бұзады. Табиғат неврологиясы, 2016.
  • Ли Х, Куваджима Т, Оакли Д және т.б. Ақуызды пренилдеу аксональды өсудің эндогендік тежегішін құрайды. Ұяшық туралы есептер. 2016.16 (2) :545 - 558.
  • Коэн Дж., Amoroso MW, Uchida N. Серотонергиялық нейрондар бірнеше рет өлшеу кезінде сыйақы мен жазалау туралы сигнал береді. eLife. 2015. 10.7554 / eLife.06346
  • Re D B, Le Verche V, Yu C, Аморосо, МВт, т.б. Некроптоз моторлы нейрондардың өлімін спорттық және отбасылық ALS модельдерінде қоздырады. Нейрон. 2014. 81 :1001 - 1008.
  • Amoroso MW, Croft GF, Williams DJ, және басқалар. Адамның дің жасушаларынан аяқ-қолды жүйкелендіретін моторлы нейрондардың жоғары өнімділігі жоғары жылдамдығы. Неврология журналы. 2013. 33 (2) :574 - 586.
  • Nédelec S, Peljto M, Shi P және т.б. Моторлы нейрон түріндегі жергілікті ақуыз синтезіне концентрацияға тәуелді талап, Аксонның нұсқауларына жауап. Неврология журналы, 2012. 32 (4) :1496 - 1506.
  • Таказава Т, Крофт Г.Ф., Amoroso MW, т.б. Адамның эмбриондық өзек жасушаларынан алынған жұлын моторы нейрондарының жетілуі. PLOS ONE, 2012. 7 (7): e40154.
  • Боулинг GL *, Kiskinis E *, Croft GF *, Аморозо, МВт *, Окли, Д * және басқалар. Адамның индуцирленген плурипотентті дің жасушаларының функционалды сипатталған тест жиынтығы. Табиғи биотехнология, 2011. 29 (3): 279 - 286. * бірінші авторлар
  • Бок С, Кискинис Е, Верстаппен Г және т.б. Адамның ES және iPS ұяшықтарының өзгеруінің анықтамалық карталары плурипотентті жасуша сызықтарын жоғары өнімділікті сипаттауға мүмкіндік береді. Ұяшық, 2011.144 (3) :439 - 452.

Жеке өмір

Матис нейробиологқа үйленген Доктор Александр Матис профессоры ассистент болып табылады Швейцария Федералдық Технологиялық Институты.[12][27]

Әдебиеттер тізімі

  1. ^ а б c г. «Адамдар». моторды адаптивті басқару зертханасы. Алынған 2020-03-25.
  2. ^ а б «Маккензи Вейгандт Матис». ғалым.гарвард.еду. Алынған 2020-03-25.
  3. ^ Аморозо, Маккензи В .; Крофт, Гист Ф .; Уильямс, Дамиан Дж.; О'Кифф, Шон; Карраско, Моника А .; Дэвис, Энн Р .; Ройбон, Лоран; Окли, Дерек Х.; Маниатис, Том; Хендерсон, Кристофер Е .; Вичтерле, Хайнек (2013-01-09). «Адамның дің жасушаларынан аяқ-қолды нервтендіретін моторлы нейрондардың жоғары өнімділігі жоғары жылдамдығы». Неврология журналы. 33 (2): 574–586. дои:10.1523 / JNEUROSCI.0906-12.2013. ISSN  1529-2401. PMC  3711539. PMID  23303937.
  4. ^ Boulting, GL *, Kiskinis, E. *, Croft, GF *, Amoroso, MW *, Oakley, DH *, Wainger, BJ, Williams, DJ, Kahler, DJ, Yamaki, M., Davidov, LS, Rodolfa, CT , Dimos, JT, Mikkilineni, S., Macdermott, AB, Woolf, CJ, Henderson, CE, Wichterle, H., & Eggan, KC (2011). Адамның индуцирленген плурипотентті дің жасушаларының функционалды сипатталған тест жиынтығы. Табиғат биотехнологиясы, 29, 279-286.
  5. ^ а б c г. e f ж сағ «МКҰ түлегі Гарвардтағы Роулэнд институты арқылы зертхананы ашады». Гарвард университеті - молекулалық және жасушалық биология кафедрасы. 2017-03-14. Алынған 2020-03-25.
  6. ^ а б «MCB-дің төрт түлегі 2013 жылы NSF серіктестігін қабылдайды». Гарвард университеті - молекулалық және жасушалық биология кафедрасы. 2013-04-11. Алынған 2020-03-25.
  7. ^ Матис, Маккензи Вейгандт; Матис, Александр; Учида, Наошиге (2017-03-22). «Somatosensory Cortex тышқандардағы мотор бейімделуінде маңызды рөл атқарады». Нейрон. 93 (6): 1493-1503.e6. дои:10.1016 / j.neuron.2017.02.049. ISSN  0896-6273. PMC  5491974. PMID  28334611.
  8. ^ Матис, Александр; Мамиданна, Пранав; Абэ, Тайга; Кюри, Кевин М .; Мерти, Венкатеш Н .; Матис, Маккензи В .; Бетге, Матиас (2018-04-09). «Терең оқытумен қолданушының анықтаған мүмкіндіктерін маркерсіз бақылау». arXiv:1804.03142 [cs.CV ].
  9. ^ «Маккензи Матис». Гарвардтың ми туралы ғылыми бастамасы. Алынған 2020-03-25.
  10. ^ а б «Сұхбат: Маккензи Матистің мінез-құлқына тереңірек ену». Технологиялық желілердің неврологиясы. Алынған 2020-03-25.
  11. ^ «Apple, Google және Facebook жануарларды зерттеу зертханаларына рейд жүргізуде». Bloomberg.com. 2019-06-18. Алынған 2020-03-25.
  12. ^ а б c Yong, Ed (2018-07-03). «Жануарлардың қозғалысын бақылау үшін ойынды өзгертетін AI құралы». Атлант. Алынған 2020-03-25.
  13. ^ «DeepLabCut». адаптивті қозғалтқышты басқару зертханасы. Алынған 2020-03-25.
  14. ^ «Мінез-құлық пен түр бойынша қозғалысты зерттеу үшін қол жетімді AI құралы». Гарвард газеті. 2018-08-30. Алынған 2020-03-25.
  15. ^ Квок, Роберта (30 қыркүйек 2019). «Терең оқыту қозғалысқа бағытталған революцияны күшейтеді». Табиғат. 574: 137–138. дои:10.1038 / d41586-019-02942-5.
  16. ^ https://www.bloomberg.com/news/features/2019-06-18/apple-google-and-facebook-are-raiding-animal-research-labs
  17. ^ https://www.theatlantic.com/science/archive/2018/07/deeplabcut-tracking-animal-movements/564338/
  18. ^ а б c «адаптивті қозғалтқышты басқару зертханасы». адаптивті қозғалтқышты басқару зертханасы. Алынған 2020-03-25.
  19. ^ а б Евангелиста, Сэнди (2019-09-27). «EPFL профессорларының ұсыныстары». Журналға сілтеме жасау қажет | журнал = (Көмектесіңдер)
  20. ^ а б «Жаңалықтар». адаптивті қозғалтқышты басқару зертханасы. Алынған 2020-03-25.
  21. ^ «CZI - ғылымға арналған ашық бастапқы кодты бағдарламалық жасақтама». Чан Цукербергтің бастамасы. Алынған 2020-03-25.
  22. ^ «Зерттеушілерге арналған алғашқы грант-2018 гранттары: алғашқы жеті автор таңдалды». eLife. 2018-04-03. Алынған 2020-03-25.
  23. ^ «BETHGE LAB · Қаржыландыру». bethgelab.org. Алынған 2020-03-25.
  24. ^ «Архивтерді марапаттау». Гарвард университеті - молекулалық және жасушалық биология кафедрасы. Алынған 2020-03-25.
  25. ^ «Эрнест Пералта қорының марапаты». Гарвард университеті - молекулалық және жасушалық биология кафедрасы. Алынған 2020-03-25.
  26. ^ «Mackenzie W. Mathis - Google Scholar сілтемелері». scholar.google.com. Алынған 2020-03-25.
  27. ^ «Александр Матис | туралы». www.people.fas.harvard.edu. Алынған 2020-03-25.