Фаг р1т холиндер отбасы - Phage r1t holin family

The Lactococcus lactis Phage r1t Holin (r1t Holin) отбасы (ТК № 1. Е.18 ) - бұл ұзындығы шамамен 65-тен 95-ке дейін амин ацил қалдықтары (aas) аралығында болатын, тесік түзетін ақуыздардың отбасы, дегенмен бірнеше r1t холиннің едәуір үлкен екендігі анықталды (яғни, 168 аа, 4 TMS, сипатталмаған холин Родококк мөлдір емес; ТК № 1. Е.18.1.9 ). Фаг r1t холиндері 2-ден 4-ке дейінгі трансмембраналық сегменттер (TMS) арасында көрінеді, олардың ішінде 4 TMS ақуыздары 2 TMS аймағының интрагенді қайталануынан туындайды. R1t holin тұқымдасына жататын ақуыздардың өкілдік тізімін мына жерден табуға болады Транспортердің жіктелуінің мәліметтер базасы.[1]

Функция және өрнек

The Lactococcus lactis фаг r1t геномына екі іргелес ген кіреді, orf48 және orf49, Orf48 кодтайтын (ТК №1. 18.1.1; 75 аас) және а лизин Orf49 (270 aas), мүмкін N-ацетил-мурамоил-L-аланинамидаза сәйкесінше. Orf48 қысқа бұрылыс аймағымен бөлінген 2 болжамды гидрофобты трансмембраналық сегменттерді (TMS) ұсынады. Оның гидрофобты қасиеті бар N-терминал және жоғары зарядталған C терминалы. Orf48 / Orf49 фаг r1t лизис кассетасын құрайды. Orf49-тің маңызды рөлі жасуша лизисі Orf48 көрсетті.[2]

Orf48 Gp4 холиніне гомологты Микобактериялар фаг Ms6 (TC # 1.E.18.1.2 ).[3] Көптеген қос тізбекті (ds) ДНҚ фагтары сияқты, Ms6 микобактериофагы да иесінің лизисіне жету үшін холин-эндолизин жүйесін қолданады. Эндолизиннен басқа (lysA) және холин (хол) гендер, Ms6 үш аксессуар лизис ақуыздарын кодтайды. Кодталған Gp1-дің лизис функциясы gp1 ағынның бойында орналасқан ген lysA, анықталды.[4]

Каталао және басқалар. байқалды Ішек таяқшасы Ms6 холині болмаған кезде LysA мен Gp1 коэкспрессиясынан кейінгі лизис. Gp1 ақуыздардың холин класына жатпайды, бірақ олар бірнеше сипаттамалармен бөліседі молекулалық шаперондар. Авторлар Gp1 LysA-мен өзара әрекеттеседі және бұл өзара әрекеттесу LysA-ны мақсатына жеткізу үшін қажет деп болжайды. PhoA термоядролары мұны көрсетті Mycobacterium smegmatis, LysA экстрацитоплазмалық ортаға Gp1 қатысуымен экспортталады, бұл тиімділікке қажет M. smegmatis лизис, Ms6 сияқты gp1 жою нәтижесінде хосттың лизис ақаулары пайда болады. Каталао және басқалар. Ms6 эндолизинін муреин қабатына жеткізуге холинге тәуелді емес шаперон тәрізді ақуыз Gp1 көмектеседі деп ұсынды.[4]

R1t Orf48 фагасы катализдейтін тасымалдау реакциясы:

лизин (в) → лизин (выход)

Сондай-ақ қараңыз

Әрі қарай оқу

Әдебиеттер тізімі

  1. ^ «1.E.18 Lactococcus lactis Phage r1t Holin (r1t Holin) отбасы». Транспортердің жіктелуінің мәліметтер базасы. Алынған 2016-03-28.
  2. ^ ван Синдерен, Д .; Карсенс, Х .; Кок, Дж .; Терпстра, П .; Риттерлер, М. Х .; Венема, Г .; Nauta, A. (1996-03-01). «R1t қалыпты лактококкты бактериофагтың реттілігін талдау және молекулалық сипаттамасы» (PDF). Молекулалық микробиология. 19 (6): 1343–1355. дои:10.1111 / j.1365-2958.1996.tb02478.x. ISSN  0950-382X. PMID  8730875. S2CID  10182620.
  3. ^ Гарсия, Мигель; Пиментель, Мадалена; Мониз-Перейра, Хосе (2002-06-01). «Микобактериофаг Ms6 лизис гендерінің экспрессиясы сигма (70) тәрізді екі промотор арқылы қозғалады және жетекші РНҚ-да болатын транскрипцияның аяқталу сигналына тәуелді». Бактериология журналы. 184 (11): 3034–3043. дои:10.1128 / jb.184.11.3034-3043.2002. ISSN  0021-9193. PMC  135080. PMID  12003945.
  4. ^ а б Каталано, Мария Джоао; Гил, Филипа; Мониз-Перейра, Хосе; Пиментель, Мадалена (2010-08-01). «Ms6 микобактериофагы эндолизинді пептидогликанға жеткізуге қатысатын шаперон тәрізді ақуызды кодтайды». Молекулалық микробиология. 77 (3): 672–686. дои:10.1111 / j.1365-2958.2010.07239.x. ISSN  1365-2958. PMID  20545844. S2CID  29630013.

Жағдай бойынша бұл редакциялау, бұл мақалада «1.E.18 Lactococcus lactis Phage r1t Holin (r1t Holin) отбасы»лицензиясы лицензия негізінде қайта пайдалануға мүмкіндік береді Creative Commons Attribution-ShareAlike 3.0 экспортталмаған лицензиясы, бірақ астында емес GFDL. Барлық сәйкес шарттар сақталуы керек.