YTH ақуызының домені - YTH protein domain
| YTH ақуызының домені | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Идентификаторлар | |||||||||
| Таңба | YTH | ||||||||
| Pfam | PF04146 | ||||||||
| Pfam ру | CL0178 | ||||||||
| InterPro | IPR007275 | ||||||||
| |||||||||
Молекулалық биологияда белоктық домен, YTH таңдап алып тастағаны көрсетілген YTH отбасының мүшесін айтады стенограммалар туралы мейоз - ерекше гендер білдірді жылы митоздық жасушалар.[1]
Бұл белоктық домен, YTH-домені, болып табылады сақталған бәріне эукариоттар және деп болжайды сақталған С-терминалы аймағы реле беруде маңызды рөл атқарады цитозоликалық Са сигналдары ядро, сол арқылы реттейді ген экспрессиясы.[2]
Функция / механизм
Жоғарыда деген болжам жасалды эукариоттық YTH-отбасы мүшелері жолын кесудің осы тетіктеріне тартылуы мүмкін гендердің реттелуі гаметогенез немесе жалпы тыныштық кезінде. The егеуқұйрық ақуыз YT521-B, SWISSPROT, бұл тирозин-фосфорланған ядролық ақуыз, яғни өзара әрекеттеседі ядролық транскриптозомдық компонентпен тіркеме B коэффициенті және 68kDa Src субстрат кезінде байланысты митоз, Sam68. In vivo қосу талдаулар YT521-B модуляциялайтынын көрсетті қосылу сайты концентрацияға тәуелді түрде таңдау.[3] Сонымен қатар, YTH доменінің РНҚ-ны байланыстырудағы рөлі бар деп ойлайды. [4]
Құрылым
Домен құрамында төртеуі бар альфа / бета-қатпар аралас болады деп болжануда альфа спиралдары және алты бета жолдары.[4]
Зауыт
Жылы өсімдік жасушалар экологиялық ынталандыру, ол жарық, патогендер, гормондар, және абиотикалық стресс, өзгертулерді анықтайды цитозоликалық кальций деңгейі, бірақ цитозолдық-ядролық Са сигнал беру жолы туралы аз біледі; қайда гендердің реттелуі сәйкес жауап беру үшін пайда болады стресс. Екі роман көрсетілген Арабидопсис талиана (Тышқан-құлақ тістері) белоктар, (ECT1 және ECT2), арнайы байланысты Кальциневрин Ser / Thr мүшесі B-тәрізді өзара әрекеттесетін протеин Kinase1 (CIPK1) белокты киназалар бұл өзара әрекеттесу кальциневринмен B-тәрізді Са-байланыстырумен белоктар. Бұл екі ақуыздың құрамында өте ұқсас C-терминал аймағы бар (180 аминқышқылдары ұзындығы бойынша, 81% ұқсастық), бұл CIPK1-мен өзара әрекеттесу үшін қажет және жеткілікті транслокация дейін ядро.
Әдебиеттер тізімі
- ^ Harigaya Y, Tanaka H, Yamanaka S, Tanaka K, Watanabe Y, Tsutsumi C, Chikashige Y, Hiraoka Y, Yamashita A, Yamamoto M (шілде 2006). «Хабарламалық РНҚ-ны іріктеп жою, мезгілсіз мейоздың пайда болуының алдын алады». Табиғат. 442 (7098): 45–50. дои:10.1038 / табиғат04881. PMID 16823445. S2CID 4383571.
- ^ Ok SH, Jeong HJ, Bae JM, Shin JS, Luan S, Kim KN (қыркүйек 2005). «Арабидопсистегі CIPK1-ге байланысты жаңа протеиндер ядролық оқшаулауды жүзеге асыратын эволюциялық консервленген С-терминал аймағын қамтиды». Өсімдіктер физиолы. 139 (1): 138–50. дои:10.1104 / б.105.065649. PMC 1203364. PMID 16113215.
- ^ Hartmann AM, Nayler O, Schwaiger FW, Obermeier A, Stamm S (қараша 1999). «Sam68-дің ядролық нүктелердегі сплитингпен байланысты фактор YT521-B-мен өзара әрекеттесуі және колокализациясы Src отбасылық киназа p59 (fyn) арқылы реттеледі». Мол. Биол. Ұяшық. 10 (11): 3909–26. дои:10.1091 / mbc.10.11.3909. PMC 25688. PMID 10564280.
- ^ а б Stoilov P, Rafalska I, Stamm S (қазан 2002). «YTH: ядролық белоктардағы жаңа домен». Трендтер биохимия. Ғылыми. 27 (10): 495–7. дои:10.1016 / S0968-0004 (02) 02189-8. PMID 12368078.