CAPN1 - CAPN1 - Wikipedia

CAPN1
Ақуыз CAPN1 PDB 1zcm.png
Қол жетімді құрылымдар
PDBОртологиялық іздеу: PDBe RCSB
Идентификаторлар
Бүркеншік аттарCAPN1, CANP, CANP1, CANPL1, muCANP, muCL, SPG76, calpain 1
Сыртқы жеке куәліктерOMIM: 114220 MGI: 88263 HomoloGene: 3800 Ген-карталар: CAPN1
Геннің орналасуы (адам)
11-хромосома (адам)
Хр.11-хромосома (адам)[1]
11-хромосома (адам)
CAPN1 үшін геномдық орналасу
CAPN1 үшін геномдық орналасу
Топ11q13.1Бастау65,180,566 bp[1]
Соңы65,212,006 bp[1]
РНҚ экспрессиясы өрнек
Fs.png мекен-жайы бойынша PBB GE CAPN1 200752 с
Қосымша сілтеме өрнегі туралы деректер
Ортологтар
ТүрлерАдамТышқан
Энтрез
Ансамбль
UniProt
RefSeq (mRNA)

NM_001198868
NM_001198869
NM_005186

NM_001110504
NM_007600

RefSeq (ақуыз)

NP_001185797
NP_001185798
NP_005177

NP_001103974
NP_031626

Орналасқан жері (UCSC)Хр 11: 65.18 - 65.21 МбХр 19: 5.99 - 6.02 Мб
PubMed іздеу[3][4]
Уикидеректер
Адамды қарау / өңдеуТінтуірді қарау / өңдеу

Calpain-1 каталитикалық суббірлік Бұл ақуыз адамдарда кодталған CAPN1 ген.[5][6][7]

Функция

The тайпалар, кальциймен белсендірілген бейтарап протеазалар, несосомалық емес, жасушаішілік цистеин протеазалары. Сүтқоректілердің балтырларына барлық жерде, асқазанға және бұлшықетке тән ақуыздар жатады. Барлық жерде кездесетін ферменттер жалпы кішігірім, реттеуші суббірлікпен байланысты айқын, каталитикалық суббірліктері бар гетеродимерлерден тұрады. Бұл ген барлық жерде кездесетін ферменттің үлкен суббірлігін кодтайды, 1 кальпайн.[7]

Өзара әрекеттесу

CAPN1 көрсетілген өзара әрекеттесу бірге PSEN2.[8]

Әдебиеттер тізімі

  1. ^ а б c GRCh38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSG00000014216 - Ансамбль, Мамыр 2017
  2. ^ а б c GRCm38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSMUSG00000024942 - Ансамбль, Мамыр 2017
  3. ^ «Адамның PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
  4. ^ «Mouse PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
  5. ^ Aoki K, Imajoh S, Ohno S, Emori Y, Koike M, Kosaki G, Suzuki K (қазан 1986). «Адамның Са2 + белсенді активтендірілген бейтарап протеазасының (muCANP) төмен-Ca2 + талап етілетін формасының үлкен суббірлігінің толық аминқышқылдарының тізбегі, оның cDNA дәйектілігінен шығарылған». FEBS Lett. 205 (2): 313–7. дои:10.1016 / 0014-5793 (86) 80919-X. PMID  3017764. S2CID  36697759.
  6. ^ Ohno S, Minoshima S, Kudoh J, Fukuyama R, Shimizu Y, Ohmi-Imajoh S, Shimizu N, Suzuki K (қараша 1990). «Calpain отбасына арналған төрт ген адамның төрт хромосомасында орналасады». Cytogenet Cell Genet. 53 (4): 225–9. дои:10.1159/000132937. PMID  2209092.
  7. ^ а б «Entrez Gene: CAPN1 calpain 1, (mu / I) үлкен суббірлік».
  8. ^ Шинозаки К, Маруяма К, Куме Х, Томита Т, Сайидо ТК, Иватсубо Т, Обата К (1998). «Пресенилин 2 циклінің домені mu-calpain C-терминал аймағымен өзара әрекеттеседі». Int. Дж.Мол. Мед. 1 (5): 797–9. дои:10.3892 / ijmm.1.5.797. PMID  9852298.

Әрі қарай оқу

Сыртқы сілтемелер

  • The MEROPS пептидазалар мен олардың ингибиторларына арналған онлайн-мәліметтер базасы C02.001
  • Адам CAPN1 геномның орналасуы және CAPN1 геннің егжей-тегжейлі беті UCSC Genome Browser.