CHMP5 - CHMP5

CHMP5
Қол жетімді құрылымдар
PDB	Ортологиялық іздеу: PDBe RCSB
PDB идентификатор кодтарының тізімі
	2LXM, 3 шілде, 3UM0, 3UM1, 3UM2, 4TXR
Идентификаторлар
Бүркеншік аттар	CHMP5, C9orf83, HSPC177, PNAS-2, SNF7DC2, Vps60, CGI-34, зарядталған мультивискулярлы дене ақуызы 5
Сыртқы жеке куәліктер	OMIM: 610900 MGI: 1924209 HomoloGene: 5757 Ген-карталар: CHMP5
Геннің орналасуы (адам)
Хр.	9-хромосома (адам)
Соңы	33,282,070 bp
Геннің орналасуы (тышқан)
Хр.	4-хромосома (тышқан)
Соңы	40,965,303 bp
РНҚ экспрессиясы өрнек
	; ;
	Қосымша сілтеме өрнегі туралы деректер
Гендік онтология
Молекулалық функция	• GO: 0001948 ақуыздармен байланысуы; • кадеринді байланыстыру;
Ұялы компонент	• цитоплазма; • цитозол; • эндосома; • мембрана; • эндосома қабығы; • жасушадан тыс экзома; • жасуша ядросы;
Биологиялық процесс	• центросоманың қайталануын реттеу; • GO: 0019067 вирустық өмірлік цикл; • ядро ұйымы; • денені сұрыптаудың көп жолды жолы; • лизосоманың тасымалдануынан эндосома; • көп салалы корпусты құрастыру; • митотикалық шпиндельді құрастыруды реттеу; • эндосомалық көлік; • ақуызды тасымалдау; • цитокинезден кейінгі жасушалардың бөлінуі; • митоздық метафаза тақтасының конгресі; • рецепторларды қайта өңдеуді реттеу; • лизосома ұйымы; • вакуольды көлік; • ESCRT III кешенді бөлшектеу; • көлік; • ортаңғы абциссия; • липополисахаридке жасушалық жауап; • мурамил дипептидке жасушалық жауап;
	Дереккөздер:Амиго / QuickGO
Ортологтар
	51510
	76959
	ENSG00000086065
	ENSMUSG00000028419
	Q9NZZ3
	Q9D7S9
	NM_016410; NM_001195536
	NM_029814
	NP_001182465; NP_057494
	NP_084090
	Уикидеректер
Адамды қарау / өңдеу	Тінтуірді қарау / өңдеу

Зарядталған мультицикулярлы дене ақуызы 5 Бұл ақуыз адамдарда кодталған CHMP5 ген.^[5]^[6]^[7]

Функция

CHMP5 келесіге жатады хроматин - модификациялаушы ақуыз / зарядталған мультивисикулярлы дене ақуызы (CHMP). Бұл белоктар компоненттер болып табылады ESCRT-III (III тасымалдауға қажет эндосомалық сұрыптау кешені), беткі рецепторлы ақуыздардың деградациясына және эндоциттік мультицикулярлы денелердің түзілуіне қатысатын кешен (MVB ). Кейбір CHMP-дің ядролық және цитоплазмалық / везикулярлық үлестірімдері бар және осындай CHMP, CHMP1A, MVB түзілуіне де, реттелуіне де қажет жасушалық цикл прогрессия.^[7]^[8]

Пайдаланылған әдебиеттер

^ ^а ^б ^c GRCh38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSG00000086065 - Ансамбль, Мамыр 2017
^ ^а ^б ^c GRCm38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSMUSG00000028419 - Ансамбль, Мамыр 2017
^ «Адамның PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
^ «Mouse PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
^ Ward DM, Vaughn MB, Shiflett SL, White PL, Pollock AL, Hill J, Schnegelberger R, Sundquist WI, Kaplan J (наурыз 2005). «LIP5 және CHMP5-тің мультивисулярлы дене түзілуіндегі маңызы және сүтқоректілер жасушаларында АИВ-1 бүршіктенуі». J Biol Chem. 280 (11): 10548–55. дои:10.1074 / jbc.M413734200. PMID 15644320.
^ Howard TL, Stauffer DR, Degnin CR, Hollenberg SM (қыркүйек 2001). «CHMP1 жаңадан анықталған көпіршіктердің айналымы белоктарының отбасының мүшесі ретінде жұмыс істейді». J ұялы ғылыми жұмыс. 114 (Pt 13): 2395-404. PMID 11559748.
^ ^а ^б «Entrez Gene: CHMP5 хроматинді өзгертетін ақуыз 5».
^ Tsang HT, Connell JW, Brown SE, Thompson A, Reid E, Sanderson CM (қыркүйек 2006). «Адамның CHMP ақуызымен өзара әрекеттесуін жүйелі түрде талдау: құрамында құрамында MIT домені бар ақуыздар адамның ESCRT III кешенінің бірнеше компоненттерімен байланысады». Геномика. 88 (3): 333–46. дои:10.1016 / j.ygeno.2006.04.003. PMID 16730941.

Сыртқы сілтемелер

Адам CHMP5 геномның орналасуы және CHMP5 геннің егжей-тегжейлі беті UCSC Genome Browser.

Әрі қарай оқу

Lai CH, Chou CY, Chang LY және т.б. (2000). «Салыстырмалы протеомика әдісімен ценорхабдита элегандарында эволюциялық жолмен сақталған адамның гендерін анықтау». Genome Res. 10 (5): 703–13. дои:10.1101 / гр.10.5.703. PMC 310876. PMID 10810093.
Чжан QH, Ye M, Ву XY және т.б. (2001). «CD34 + гемопоэтический бағанында / тұқымдас жасушаларында көрсетілген 300 бұрын анықталмаған гендер үшін ашық оқудың рамалары бар кДНҚ-ны клондау және функционалдық талдау». Genome Res. 10 (10): 1546–60. дои:10.1101 / гр.140200. PMC 310934. PMID 11042152.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH және т.б. (2003). «Адам мен тышқанның 15000-нан астам толық ұзындықтағы кДНҚ тізбектерінің генерациясы және алғашқы талдауы». Proc. Натл. Акад. Ғылыми. АҚШ. 99 (26): 16899–903. дои:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Strack B, Calistri A, Крейг S және т.б. (2003). «AIP1 / ALIX - бұл ВИЧ-1 р6 және EIAV p9 вирустың бүршіктенуінде жұмыс істейтін байланыстырушы серіктес». Ұяшық. 114 (6): 689–99. дои:10.1016 / S0092-8674 (03) 00653-6. PMID 14505569. S2CID 10733770.
фон Шведлер Ұлыбритания, Штухелл М, Мюллер Б және т.б. (2003). «АҚТҚ-ның бүршіктенуінің ақуыздық желісі». Ұяшық. 114 (6): 701–13. дои:10.1016 / S0092-8674 (03) 00714-1. PMID 14505570. S2CID 16894972.
Мартин-Серрано Дж, Яровой А, Перес-Кабальеро Д және т.б. (2003). «Дивергентті ретровирустық кеш пайда болатын домендер альтернативті адаптер белоктарын қолдану арқылы вакуолярлы белокты сұрыптау факторларын қолданады». Proc. Натл. Акад. Ғылыми. АҚШ. 100 (21): 12414–9. дои:10.1073 / pnas.2133846100. PMC 218772. PMID 14519844.
Хамфрей С.Ж., Оливер К, Хант А.Р. және т.б. (2004). «ДНҚ тізбегі және адамның 9-хромосомасын талдау». Табиғат. 429 (6990): 369–74. дои:10.1038 / табиғат02465. PMC 2734081. PMID 15164053.
Герхард Д.С., Вагнер Л, Фейнголд Е.А. және т.б. (2004). «NIH толық ұзындықтағы cDNA жобасының мәртебесі, сапасы және кеңеюі: Сүтқоректілер гендерінің коллекциясы (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121-7. дои:10.1101 / гр.2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Rual JF, Венкатесан К, Хао Т және т.б. (2005). «Адамның протеин-протеинмен өзара әрекеттесу желісінің протеомды масштабты картасына қарай». Табиғат. 437 (7062): 1173–8. дои:10.1038 / табиғат04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Ewing RM, Chu P, Elisma F және т.б. (2007). «Масс-спектрометрия әдісімен адамның ақуыз-ақуыздың өзара әрекеттесуінің ауқымды картасы». Мол. Сист. Биол. 3 (1): 89. дои:10.1038 / msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931.

Бұл мақалада Америка Құрама Штаттарының Ұлттық медицина кітапханасы, ол қоғамдық домен.

Бұл мақала а ген қосулы адамның хромосомасы 9 Бұл бұта. Сіз Уикипедияға көмектесе аласыз оны кеңейту.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c GRCh38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSG00000086065 - Ансамбль, Мамыр 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSMUSG00000028419 - Ансамбль, Мамыр 2017

[3] «Адамның PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.

[4] «Mouse PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.

[pmid15644320-5] Ward DM, Vaughn MB, Shiflett SL, White PL, Pollock AL, Hill J, Schnegelberger R, Sundquist WI, Kaplan J (наурыз 2005). «LIP5 және CHMP5-тің мультивисулярлы дене түзілуіндегі маңызы және сүтқоректілер жасушаларында АИВ-1 бүршіктенуі». J Biol Chem. 280 (11): 10548–55. дои:10.1074 / jbc.M413734200. PMID 15644320.

[pmid11559748-6] Howard TL, Stauffer DR, Degnin CR, Hollenberg SM (қыркүйек 2001). «CHMP1 жаңадан анықталған көпіршіктердің айналымы белоктарының отбасының мүшесі ретінде жұмыс істейді». J ұялы ғылыми жұмыс. 114 (Pt 13): 2395-404. PMID 11559748.

[entrez-7] а ^б «Entrez Gene: CHMP5 хроматинді өзгертетін ақуыз 5».

[pmid16730941-8] Tsang HT, Connell JW, Brown SE, Thompson A, Reid E, Sanderson CM (қыркүйек 2006). «Адамның CHMP ақуызымен өзара әрекеттесуін жүйелі түрде талдау: құрамында құрамында MIT домені бар ақуыздар адамның ESCRT III кешенінің бірнеше компоненттерімен байланысады». Геномика. 88 (3): 333–46. дои:10.1016 / j.ygeno.2006.04.003. PMID 16730941.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]