L типті лектин домені - L-type lectin domain
| Лектинді_тектес | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 p58 / ergic-53 гликопротеинді сұрыптайтын рецептордың көмірсулар тану аймағының кристалды құрылымы металдың жаңа байланысатын орнын және кальций ионымен байланысқан конформациялық өзгерістерді анықтайды | |||||||||
| Идентификаторлар | |||||||||
| Таңба | Лектинді_тектес | ||||||||
| Pfam | PF03388 | ||||||||
| Pfam ру | CL0004 | ||||||||
| InterPro | IPR005052 | ||||||||
| SCOP2 | 1gv9 / Ауқымы / SUPFAM | ||||||||
| Мембрана | 719 | ||||||||
| |||||||||
Молекулалық биологияда L тәрізді лектиндік домен Бұл белоктық домен табылды дәрістер ұқсас бұршақ тұқымдас өсімдік лектиндері.
Лектиндер құрылымы жағынан алуан түрлі белоктар бұл байланыстыру нақтыға көмірсулар. Бұл отбасыға VIP36 және ERGIC-53 дәрістер.[1] Бұл доменді қамтитын ақуыздар бастапқыда жануарлар лектиндер тұқымдасы ретінде анықталғанымен, бар ашытқы өкілдері.[1]
ERGIC-53 - бұл аралық аймаққа локализацияланған 53kDa ақуызы эндоплазмалық тор және Гольджи аппараты (ER-Golgi-аралық бөлім, ERGIC). Ол ретінде анықталды кальций - тәуелді, маноз - арнайы дәріс.[2] Оның дисфункция біріктірілгенімен байланысты болды факторлар V және VIII ERGIC-53 үшін маңызды және субстратқа тән рөлді ұсынатын жетіспеушілік гликопротеин - құпия жол.[2][3]
L тәрізді лектин доменінің а-дан тұратын жалпы шар тәрізді формасы бар бета-сэндвич екі үлкен бұралған антипараллель бета-парақтар. Бета-сэндвич майордан тұрады ойыс бета-парақ және кәмелетке толмаған дөңес бета-парағы, вариациясымен желе орамы.[4][5][6][7]
Әдебиеттер тізімі
- ^ а б Фидлер К, Симонс К (маусым 1994). «Бұршақ тұқымдасына жататын лектиндерге гомологты секреторлық жолдағы жануарлар лектиндерінің романдық класы». Ұяшық. 77 (5): 625–6. дои:10.1016/0092-8674(94)90047-7. PMID 8205612. S2CID 21111364.
- ^ а б Itin C, Roche AC, Monsigny M, Hauri HP (наурыз 1996). «ERGIC-53 - бұл бұршақты лектиндердің функционалды манозды-селективті және кальцийге тәуелді адам гомологы». Мол. Биол. Ұяшық. 7 (3): 483–93. дои:10.1091 / mbc.7.3.483. PMC 275899. PMID 8868475.
- ^ Nichols WC, Terry VH, Wheatley MA, Yang A, Zivelin A, Ciavarella N, Stefanile C, Matsushita T, Saito H, de Bosch NB, Ruiz-Saez A, Torres A, Thompson AR, Feinstein DI, White GC, Negrier C , Vinciguerra C, Aktan M, Kaufman RJ, Ginsburg D, Seligsohn U (сәуір 1999). «V және VIII жетіспейтін отбасылардың 19 аралас факторындағы ERGIC-53 гендік құрылымы және мутациялық талдау». Қан. 93 (7): 2261–6. PMID 10090935.
- ^ Velloso LM, Svensson K, Schneider G, Pettersson RF, Lindqvist Y (мамыр 2002). «Эндоплазмалық тордан гликопротеинді шығаруға қатысатын ақуыз, p58 / ERGIC-53 көмірсулар тану аймағының кристалдық құрылымы». Дж.Биол. Хим. 277 (18): 15979–84. дои:10.1074 / jbc.M112098200. PMID 11850423.
- ^ Velloso LM, Svensson K, Pettersson RF, Lindqvist Y (желтоқсан 2003). «Гликопротеинді сұрыптайтын p58 / ERGIC-53 рецепторының көмірсулар-тану аймағының кристалдық құрылымы металмен байланыстырудың алдын-ала болжанбаған орнын және кальций ионымен байланысумен байланысты конформациялық өзгерістерді анықтайды». Дж.Мол. Биол. 334 (5): 845–51. дои:10.1016 / j.jmb.2003.10.031. PMID 14643651.
- ^ Сатох Т, Сато К, Канох А, Ямашита К, Ямада Ю, Игараши Н, Като Р, Накано А, Вакацуки С (сәуір 2006). «Са2 + тәуелді емес жүк рецепторларының көмірсуларды тану доменінің құрылымдары Emp46p және Emp47p». Дж.Биол. Хим. 281 (15): 10410–9. дои:10.1074 / jbc.M512258200. PMID 16439369.
- ^ Satoh T, Cowieson NP, Hakamata W, Ideo H, Fukushima K, Kurihara M, Kato R, Yamashita K, Wakatsuki S (қыркүйек 2007). «VIP36 сүтқоректілердің лектині арқылы жоғары манозды типті гликопротеидтерді танудың құрылымдық негіздері» (PDF). Дж.Биол. Хим. 282 (38): 28246–55. дои:10.1074 / jbc.M703064200. PMID 17652092. S2CID 33042130.