MED26 - MED26
| Med26 | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 тінтуірдің транскрипциясының созылу коэффициенті s-ii ақуызының n-терминалды доменінің шешім құрылымы | |||||||||
| Идентификаторлар | |||||||||
| Таңба | Med26 N-терминал домені | ||||||||
| Pfam | PF08711 | ||||||||
| InterPro | IPR017923 | ||||||||
| |||||||||
| Медиатор суббірлігі 26 Орта домен | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Идентификаторлар | |||||||||
| Таңба | Med26_M | ||||||||
| Pfam | PF15694 | ||||||||
| |||||||||
| Медиатор суббірлік 26 C-терминал домені | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Идентификаторлар | |||||||||
| Таңба | Med26_C | ||||||||
| Pfam | PF15693 | ||||||||
| |||||||||
РНҚ полимераз II транскрипциясының суббірліктің медиаторы 26 болып табылады фермент адамдарда кодталған MED26 ген.[5][6]Ол бөлігін құрайды Медиаторлар кешені.
Гендердің транскрипциясын белсендіру - бұл ДНҚ-да транскрипциялық күшейткіш орындарды танитын факторлардың әсерінен болатын көп сатылы процесс. Бұл факторлар ко-активаторлармен РНҚ-полимераза II аппаратының транскрипциялық инициациясын бағыттау үшін жұмыс істейді. Бұл генмен кодталған ақуыз - TFIID-мен бірге SP1-мен тиімді активтендіру үшін қажет болатын CRSP (SP1 активациясына қажет кофактор) кешенінің суббірлігі. Бұл ақуыз сонымен қатар басқа мультисубитті кешендердің құрамдас бөлігі болып табылады, мысалы. Қалқанша безінің гормондарының рецепторлары (TR-) байланысты, олар ТР-мен әрекеттеседі және инициациялық факторлармен және коакторлармен бірге ДНҚ шаблондарында ТР функциясын жеңілдетеді.[6]
Қызмет
MED26 - бұл транскрипция созылу коэффициенті бұл жалпы өседі транскрипция РНҚ жылдамдығы полимераза II қалпына келтіру арқылы транскрипция тұтқындаған ұзарту кешендері транскрипция. Мұны ELL / EAF- және P-TEFb бар кешендерді промоутерлерге N-терминал доменімен (NTD) тікелей өзара әрекеттесу арқылы тарту арқылы жүзеге асырады. MED26 NTD сонымен қатар TFIID байланыстырады, ал TFIID және созылу комплекстері MED26-мен қабаттасқан байланыстыру учаскелері арқылы өзара әрекеттеседі.[7]MED26 NTD Pol II-нің өнімді ұзаруына ауысуына ықпал ететін молекулалық қосқыш ретінде жұмыс істей алады.
Үшеу құрылымдық домендер TFIIS болып табылады сақталған бастап ашытқы дейін адам. 80-ге жуық N-терминал қалдықтар а ақуыз өзара әрекеттесу домен құрамында LW деп аталатын сақталған мотив бар мотив инвариантты болғандықтан лейцин және триптофан оның құрамындағы қалдықтар N-терминалының домені қажет емес болса да транскрипциялық ұқсастық жүйелі басқаларында анықталған транскрипция факторлары және белоктар олар басым ядролық жергілікті ,:[8][9]
- MED26 (CRSP70 және ARC70 деп те аталады), Sp1 күшейткішті байланыстыратын ақуыздың белсенділігі үшін қажет, Медиатор кешенінің суббірлігі.
- Элонгин А, бұрын SIII деп аталған транскрипцияның созылу факторының суббірлігі. Бұл созылудың уақытша кідірісін басу арқылы транскрипция жылдамдығын арттырады күрделі.
- PPP1R10, ядролық нормативтік ақуыздың суббірлігі фосфатаза 1 бұрын p99, FB19 немесе PNUTS ретінде белгілі болды.
- PIBP, а болуы мүмкін шағын гипотетикалық ақуыз фосфоинозит міндетті ақуыз.
- IWS1, ол екеуінде де жұмыс істейді деп ойлайды транскрипцияны бастау және созылу. TFIIS N-терминалының домені - төрт бұрандалы ықшам байлам. The гидрофобты ядро қалдықтары спиральдар 2, 3 және 4 TFIIS домендерінің арасында жақсы сақталған, дегенмен спираль 1 аз сақталған.[9]
Өзара әрекеттесу
MED26 көрсетілген өзара әрекеттесу бірге MED8,[10] Циклинге тәуелді киназа 8,[10] POLR2A,[10] MED12[10] және MED28.[10] Сонымен қатар, өзара әрекеттесуге делдал болу үшін синергетикалық әсер етеді Демалыс (900-ден астам адамның гендерінде болатын 21-bp RE1 тыныштық элементімен байланысатын Круппел типті мырыш саусақ транскрипциясы коэффициенті) және Медиатор.[11]
Пайдаланылған әдебиеттер
- ^ а б c GRCh38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSG00000105085 - Ансамбль, Мамыр 2017
- ^ а б c GRCm38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSMUSG00000045248 - Ансамбль, Мамыр 2017
- ^ «Адамның PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
- ^ «Mouse PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
- ^ Ryu S, Zhou S, Ladurner AG, Tjian R (ақпан 1999). «Транскрипциялық кофакторлы кешен CRSP күшейткішпен байланысатын Sp1 ақуызының белсенділігі үшін қажет». Табиғат. 397 (6718): 446–50. дои:10.1038/17141. PMID 9989412. S2CID 4405569.
- ^ а б «Entrez Gene: CR17 кофакторы, Sp1 транскрипциясын белсендіру үшін қажет, суббірлік 7, 70кДа».
- ^ Такахаши Х, Пармели Т.Дж., Сато С, Томомори-Сато С, Банктер Калифорния, Конг SE және т.б. (2011). «MED26 адам медиаторы суббірлігі транскрипцияның созылу факторларын қондыру орны ретінде жұмыс істейді». Ұяшық. 146 (1): 92–104. дои:10.1016 / j.cell.2011.06.005. PMC 3145325. PMID 21729782.
- ^ Booth V, Koth CM, Edwards AM, Arrowsmith CH (қазан 2000). «TFIIS, elongin A және CRSP70 транскрипция факторларына ортақ сақталған домен құрылымы». Дж.Биол. Хим. 275 (40): 31266–8. дои:10.1074 / jbc.M002595200. PMID 10811649.
- ^ а б Ling Y, Smith AJ, Morgan GT (2006). «Әр түрлі ядролық ақуыздарда сақталған дәйектілік мотиві адамның TFIIS ядролық нысанаға алу үшін пайдаланатын ақуыздардың өзара әрекеттесу аймағын анықтайды». Нуклеин қышқылдары. 34 (8): 2219–29. дои:10.1093 / nar / gkl239. PMC 1450333. PMID 16648364.
- ^ а б c г. e Sato S, Tomomori-Sato C, Parmely TJ, Florens L, Zybailov B, Swanson SK, Banks CA, Jin J, Cai Y, Washburn MP, Conaway JW, Conaway RC (маусым 2004). «Көп өлшемді ақуызды сәйкестендіру технологиясымен анықталған келісім бойынша сүтқоректілер медиаторының суббірліктерінің жиынтығы». Мол. Ұяшық. 14 (5): 685–91. дои:10.1016 / j.molcel.2004.05.006. PMID 15175163.
- ^ Ding N, Tomomori-Sato C, Sato S, Conaway RC, Conaway JW, Boyer TG (қаңтар 2009). «MED19 және MED26 - бұл нейрондық гендік экспрессияның эпигенетикалық тынышталуындағы RE1 тыныштық транскрипция факторының синергетикалық функционалды мақсаттары». Дж.Биол. Хим. 284 (5): 2648–56. дои:10.1074 / jbc.M806514200. PMC 2631966. PMID 19049968.
Әрі қарай оқу
- Näär AM, Beaurang PA, Zhou S, et al. (1999). «Композициялық ко-активатор ARC хроматинге бағытталған транскрипциялық активацияны жүзеге асырады». Табиғат. 398 (6730): 828–32. дои:10.1038/19789. PMID 10235267. S2CID 23646963.
- Booth V, Koth CM, Edwards AM, Arrowsmith CH (2000). «TFIIS, elongin A және CRSP70 транскрипция факторларына ортақ сақталған домен құрылымы». Дж.Биол. Хим. 275 (40): 31266–8. дои:10.1074 / jbc.M002595200. PMID 10811649.
- Näär AM, Taatjes DJ, Zhai W және т.б. (2002). «Адам CRSP РНҚ полимераз II CTD-мен өзара әрекеттеседі және белгілі бір CTD байланысқан конформацияны қабылдайды». Genes Dev. 16 (11): 1339–44. дои:10.1101 / gad.987602. PMC 186316. PMID 12050112.
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH және т.б. (2003). «Адам мен тышқанның 15000-нан астам толық ұзындықтағы кДНҚ тізбектерінің генерациясы және алғашқы талдауы». Proc. Натл. Акад. Ғылыми. АҚШ. 99 (26): 16899–903. дои:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
- Sato S, Tomomori-Sato C, Banks CA және басқалар. (2004). «Drosophila melanogaster транскрипциялық коактиватор интерсексінің сүтқоректілер гомологы - бұл сүтқоректілер медиаторы кешенінің суббірлігі». Дж.Биол. Хим. 278 (50): 49671–4. дои:10.1074 / jbc.C300444200. PMID 14576168.
- Tomomori-Sato C, Sato S, Parmely TJ және т.б. (2004). «Saccharomyces cerevisiae медиаторының суббірлік Cse2-мен бөлісетін сүтқоректілер медиаторының суббірлігі». Дж.Биол. Хим. 279 (7): 5846–51. дои:10.1074 / jbc.M312523200. PMID 14638676.
- Ота Т, Сузуки Ю, Нишикава Т және т.б. (2004). «Адамның 21,243 толық ұзындықтағы кДНҚ-ның толық тізбегі және сипаттамасы». Нат. Генет. 36 (1): 40–5. дои:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
- Mo X, Kowenz-Leutz E, Xu H, Leutz A (2004). «Рас C / EBP бета-нұсқасында медиаторлардың кешенді алмасуын тудырады». Мол. Ұяшық. 13 (2): 241–50. дои:10.1016 / S1097-2765 (03) 00521-5. PMID 14759369.
- Sato S, Tomomori-Sato C, Parmely TJ және т.б. (2004). «Көп өлшемді ақуызды сәйкестендіру технологиясымен анықталған келісім бойынша сүтқоректілер медиаторының суббірліктерінің жиынтығы». Мол. Ұяшық. 14 (5): 685–91. дои:10.1016 / j.molcel.2004.05.006. PMID 15175163.
- Чжан Х, Крутчинский А, Фукуда А және т.б. (2005). «MED1 / TRAP220 негізінен РНҚ-полимераза II-де байытылған TRAP / Mediator субпопуляциясында бар және ER-медиацияланған транскрипция үшін қажет». Мол. Ұяшық. 19 (1): 89–100. дои:10.1016 / j.molcel.2005.05.015. PMID 15989967.
- Олсен БК, Благоев Б, Гнад Ф және т.б. (2006). «Сигналды желілердегі ғаламдық, in vivo және нақты фосфорлану динамикасы». Ұяшық. 127 (3): 635–48. дои:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID 17081983. S2CID 7827573.