NBPF19 - NBPF19

NBPF19
Идентификаторлар
Бүркеншік аттарNBPF19, NBPF мүшесі 19
Сыртқы жеке куәліктерOMIM: 614006 HomoloGene: 41035 Ген-карталар: NBPF19
Геннің орналасуы (адам)
1-хромосома (адам)
Хр.1-хромосома (адам)[1]
1-хромосома (адам)
NBPF19 үшін геномдық орналасу
NBPF19 үшін геномдық орналасу
Топ1q21.2Бастау149,475,338 bp[1]
Соңы149,556,361 bp[1]
Ортологтар
ТүрлерАдамТышқан
Энтрез

101060226

жоқ

Ансамбль

ENSG00000271383

жоқ

UniProt

Q7Z3S9

жоқ

RefSeq (mRNA)

NM_001351365

жоқ

RefSeq (ақуыз)

NP_001350936
NP_001350937

жоқ

Орналасқан жері (UCSC)Chr 1: 149.48 - 149.56 Mbжоқ
PubMed іздеу[2]жоқ
Уикидеректер
Адамды қарау / өңдеу

19. Нейробластома үзіліс нүктесінің отбасы мүшесі, немесе NBPF19, Бұл ақуыз бұл адамдар NBPF19 кодталған ген.[3] Бұл ақуыз ақуыздардың нейробластома үзіліс тобына кіреді.[4]

Джин

NBPF19 гені - адамда белокты кодтайтын ген. Ол барлық интрондар мен экзондарды қосқанда 80 464 негізден тұрады. Ол хромосоманың 1 оң тізбегінде 1q21.2 локусында орналасқан.[5]

NBPF19-тің тіндік және денсаулық жағдайы туралы мәліметтерді көрсететін EST профиль деректері.[6]

Өрнек

Оңтүстік Америка шығыс бөлігінің стандартты уақыты NBPF19 профилі оны барлық жерде адам тіндерінде ерекше мөлшерде көрінетінін көрсетеді. Ол салыстырмалы түрде жоғары мөлшерде көрсетілген тері, лимфоидты органдар (лимфа түйіндері, көкбауыр ) және жыныс бездері (аналық без, аталық бездер ).[5]

Транскрипт

Адамдардағы NBPF19 мРНҚ-транскрипциясы 13190 құрайды негіздер ұзақ.[7] Біріктірілген изоформалардың альтернативті 2 баламасы бар, бірақ эксперименталды түрде байқалмаған.[8]

Ақуыз

NBPF19 транскриптінің ақуыздық өнімі 3,843 аминқышқылынан және салмағы 440,5 кД құрайды.[8][9] Оның құрамында DUF1220 белгісіз функциясы бар, бірақ олар эволюциялық өзгерістермен байланысты және адамдардан эволюциялық түрде алыстап бара жатқан түрлердің саны азаяды.[10]

NBPF19 ақуызының қайталанатын фосфорлану үлгісі.[11]

Құрылым

NBPF19 көптеген аудармадан кейінгі түрлендірулерден өтеді деп күтілуде, ең бастысы фосфорлану және жиынтықтау. Ақуыз серин, треонин және тирозин қалдықтарында фосфорланған, сол жақта суретте көрсетілген қайталанатын қалыпта.[11] Ақуыздар тізбегінде сумоиляция орындары болуы мүмкін 14 болжамды қайталанулар бар.[12]

NBPF19 үшінші құрылымы шамамен 50% катушка және 40% құрайды деп болжануда альфа спираль.[13] Сигнал пептиді немесе трансмембраналық домендер жоқ.[14] NBPF19, мүмкін, локализацияланған ядро оның 5 'терминалының жанында ядролық оқшаулау сигналының болуына байланысты.[15]

Гомология

NBPF19 - бұл адамдардағы ақуыздардың нейробластома үзілістер тобының анықталған 26 мүшесінің бірі. Осы ақуыздар арасындағы дәйектілік ұқсастығы көбінесе DUF1220 домендерін сақтаумен шектеледі.[8] Ұқсас параллельдер төменде келтірілген:

Таңдалған NBPF19 параллельдері
Ген атауыҚосылу нөміріҰзындығы (аа)Реттік сәйкестілік
NBPF14NP_056198.2281996%
NBPF20NP_001265196520793%
NBPF10CAM23768461293%
NBPF12NP_001265070.1145792%
NBPF1NP_060410.2121491%
NBPF26NP_001338301.1136675%

NBPF19 адамдардан тыс жақсы сақталмаған және кез-келген елеулі консервация өткен приматтар мен сүтқоректілерге әсер етпейді.[16] Таңдау түрлерінің қысқа ұқсастықтары бар және олар төменде келтірілген:

Әдебиеттер тізімі

  1. ^ а б c GRCh38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSG00000271383 - Ансамбль, Мамыр 2017
  2. ^ «Адамның PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
  3. ^ «Entrez Gene: NBPF мүшесі 19». Алынған 2018-05-04.
  4. ^ Vandepoele K, Van Van N, Staes K, Speleman F, van Roy F (қараша 2005). «NBPF жаңа гендер тұқымдасы: приматтар эволюциясы кезінде гендердің қайталануы нәтижесінде пайда болатын күрделі құрылым». Молекулалық биология және эволюция. 22 (11): 2265–74. дои:10.1093 / molbev / msi222. PMID  16079250.
  5. ^ а б «NBPF19 NBPF мүшесі 19 [Homo sapiens (адам)] - Ген - NCBI». www.ncbi.nlm.nih.gov. Алынған 2018-05-05.
  6. ^ «Home - UniGene - NCBI». www.ncbi.nlm.nih.gov. Алынған 2018-05-05.
  7. ^ «Homo sapiens NBPF мүшесі 19 (NBPF19), mRNA - Nucleotide - NCBI». www.ncbi.nlm.nih.gov. Алынған 2018-05-05.
  8. ^ а б c «нейробластома үзіліс нүктесінің отбасы мүшесі 19 [Homo sapiens] - ақуыз - NCBI». www.ncbi.nlm.nih.gov. Алынған 2018-05-05.
  9. ^ EMBL-EBI. «SAPS нәтижелері». www.ebi.ac.uk. Алынған 2018-05-05.
  10. ^ O'Bleness MS, Диккенс CM, Dumas LJ, Kehrer-Sawatzki H, Wyckoff GJ, Sikela JM (қыркүйек 2012). «DUF1220 ақуыз домендерінің эволюциялық тарихы және геномдық ұйымы». G3. 2 (9): 977–86. дои:10.1534 / g3.112.003061. PMC  3429928. PMID  22973535.
  11. ^ а б «NetPhos 3.1 сервері». www.cbs.dtu.dk. Алынған 2018-05-05.
  12. ^ «SUMOplot ™ талдау бағдарламасы |. www.abgent.com. Алынған 2018-05-05.
  13. ^ «Протеиннің қосымша құрылымын болжау сервері». crdd.osdd.net. Алынған 2018-05-05.
  14. ^ «Фобиус». phobius.sbc.su.se. Алынған 2018-05-05.
  15. ^ «NLS Mapper». nls-mapper.iab.keio.ac.jp. Алынған 2018-05-05.
  16. ^ «BLAST: Негізгі туралау іздеу құралы». blast.ncbi.nlm.nih.gov. Алынған 2018-05-06.

Әрі қарай оқу