NFKBIL1 - NFKBIL1

NFKBIL1
Идентификаторлар
Бүркеншік аттарNFKBIL1, IKBL, LST1, NFKBIL, NFKB ингибиторы 1 сияқты
Сыртқы жеке куәліктерOMIM: 601022 MGI: 1340031 HomoloGene: 3671 Ген-карталар: NFKBIL1
Геннің орналасуы (адам)
6-хромосома (адам)
Хр.6-хромосома (адам)[1]
6-хромосома (адам)
NFKBIL1 үшін геномдық орналасу
NFKBIL1 үшін геномдық орналасу
Топ6p21.33Бастау31,546,870 bp[1]
Соңы31,558,829 bp[1]
РНҚ экспрессиясы өрнек
PBB GE NFKBIL1 209973 at fs.png
Қосымша сілтеме өрнегі туралы деректер
Ортологтар
ТүрлерАдамТышқан
Энтрез
Ансамбль
UniProt
RefSeq (mRNA)

NM_005007
NM_001144961
NM_001144962
NM_001144963

NM_010909
NM_001364909

RefSeq (ақуыз)

NP_001138433
NP_001138434
NP_001138435
NP_004998

NP_035039
NP_001351838

Орналасқан жері (UCSC)Chr 6: 31.55 - 31.56 MbХр 17: 35.22 - 35.24 Мб
PubMed іздеу[3][4]
Уикидеректер
Адамды қарау / өңдеуТінтуірді қарау / өңдеу

NF-каппа-В ингибиторына ұқсас ақуыз 1 Бұл ақуыз адамдарда кодталған NFKBIL1 ген.[5][6]

Функция

Бұл ген I-каппа-В ақуыздар тобының дивергентті мүшесін кодтайды. Оның қызметі түсініксіз. Ген 6-хромосомада орналасқан І класс аймағындағы негізгі гистосәйкестік кешенінде орналасқан.[6]

Үлгілі организмдер

Үлгілі организмдер NFKBIL1 функциясын зерттеуде қолданылған. Шартты тінтуір желі деп аталады Nfkbil1tm1a (KOMP) Wtsi кезінде құрылды Wellcome Trust Sanger институты.[7] Еркек пен аналық жануарлар стандартталған түрде өтті фенотиптік экран[8] жоюдың әсерін анықтау.[9][10][11][12] Қосымша экрандар орындалды: - терең иммунологиялық фенотиптеу[13]

Пайдаланылған әдебиеттер

  1. ^ а б c ENSG00000234530, ENSG00000236346, ENSG00000235125, ENSG00000236196, ENSG00000204498, ENSG00000227565 GRCh38: Ансамбль шығарылымы 89: ENSG00000206440, ENSG00000234530, ENSG00000236300, ENGG00000236300, ENGG00000236346, - Ансамбль, Мамыр 2017
  2. ^ а б c GRCm38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSMUSG00000042419 - Ансамбль, Мамыр 2017
  3. ^ «Адамның PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
  4. ^ «Mouse PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
  5. ^ Альбертелла М.Р., Кэмпбелл РД (мамыр 1994). «І каппа B ақуыздар тобының әлеуетті жаңа мүшесін кодтайтын адамның негізгі гистосәйкестік кешеніндегі жаңа геннің сипаттамасы». Адам молекулалық генетикасы. 3 (5): 793–9. дои:10.1093 / мг / 3.5.793. PMID  8081366.
  6. ^ а б «Entrez Gene: B-жасушаларында ингибитор тәрізді 1-дегі каппа жеңіл полипептидті генді күшейтетін NFKBIL1 ядролық факторы».
  7. ^ Гердин А.К. (2010). «Sanger Mouse Genetics бағдарламасы: нокаут тышқандарының жоғары сипаттамасы». Acta Ophthalmologica. 88: 925–7. дои:10.1111 / j.1755-3768.2010.4142.x. S2CID  85911512.
  8. ^ а б «Халықаралық тышқан фенотиптеу консорциумы».
  9. ^ Skarnes WC, Rosen B, West AP, Koutsourakis M, Bushell W, Iyer V, Mujica AO, Thomas M, Harrow J, Cox T, Jackson D, Severin J, Biggs P, Fu J, Nefedov M, de Jong PJ, Стюарт AF, Bradley A (маусым 2011). «Тышқанның генінің қызметін геном бойынша зерттеу үшін шартты нокаут ресурсы». Табиғат. 474 (7351): 337–42. дои:10.1038 / табиғат10163. PMC  3572410. PMID  21677750.
  10. ^ Dolgin E (маусым 2011). «Тышқан кітапханасы нокаутқа айналды». Табиғат. 474 (7351): 262–3. дои:10.1038 / 474262a. PMID  21677718.
  11. ^ Коллинз Ф.С., Россант Дж, Вурст В (қаңтар 2007). «Барлық себептер бойынша тышқан». Ұяшық. 128 (1): 9–13. дои:10.1016 / j.cell.2006.12.018. PMID  17218247. S2CID  18872015.
  12. ^ White JK, Gerdin AK, Karp NA, Ryder E, Buljan M, Bussell JN, Salisbury J, Clare S, Ingham NJ, Podrini C, Houghton R, Estabel J, Bottomley JR, Melvin DG, Sunter D, Adams NC, Tannahill D , Logan DW, Macarthur DG, Flint J, Mahajan VB, Tsang SH, Smyth I, Watt FM, Skarnes WC, Dougan G, Adams DJ, Ramirez-Solis R, Bradley A, Steel KP (шілде 2013). «Нокаут тышқандарын жалпы геномдық генерациялау және жүйелі фенотиптеу көптеген гендердің жаңа рөлдерін ашады». Ұяшық. 154 (2): 452–64. дои:10.1016 / j.cell.2013.06.022. PMC  3717207. PMID  23870131.
  13. ^ а б «Инфекция және иммунитетті иммунофенотиптеу (3i) консорциумы».

Әрі қарай оқу

  • Iris FJ, Bougueleret L, Prieur S, Caterina D, Primas G, Perrot V, Jurka J, Rodriguez-Tome P, Claverie JM, Dausset J (ақпан 1993). «Тығыз Алу кластері және 90 килобазалық HLA III класс сегментіндегі NF каппа B отбасының жаңа мүшесі». Табиғат генетикасы. 3 (2): 137–45. дои:10.1038 / ng0293-137. PMID  8499947. S2CID  33041319.
  • Шиина Т, Тамия Г, Ока А, Ямагата Т, Ямагата Н, Киккава Е, Гото К, Мизуки Н, Ватанабе К, Фукузуми Ю, Тагучи С, Сугавара С, Оно А, Чен Л, Ямазаки М, Таширо Х, Андо А , Ikemura T, Kimura M, Inoko H (ақпан 1998). «HLA I класты аймақтың центромерлі ұшындағы IkBL және MICA гендерінің айналасындағы 146 килобазалық сегменттің нуклеотидтер тізбегін талдау». Геномика. 47 (3): 372–82. дои:10.1006 / geno.1997.5114. PMID  9480751.
  • Невилл МЖ, Кэмпбелл RD (сәуір 1999). «Ig супфамилиясының жаңа мүшесі және V-ATPase G суббірлігі адамның MHC-де TNF локусына жақын роман гендерінің болжамды өнімдерінің қатарына кіреді». Иммунология журналы. 162 (8): 4745–54. PMID  10202016.
  • Allcock RJ, Christianen FT, баға P (шілде 1999). «IHBL орталық MHC гені құрылымдық полиморфизмді жүзеге асырады, ол HLA-A3, B7, DR15-пен байланысты». Иммуногенетика. 49 (7–8): 660–5. дои:10.1007 / s002510050662. PMID  10369924. S2CID  32440895.
  • Окамото К, Макино С, Йошикава Ю, Такаки А, Нагацука Ю, Ота М, Тамия Г, Кимура А, Бахрам С, Иноко Н (ақпан 2003). «I kappa BL-ді ревматоидты артриттің екінші негізгі гистосәйкестік кешенді-сезімталдық локусы ретінде анықтау». Американдық генетика журналы. 72 (2): 303–12. дои:10.1086/346067. PMC  379224. PMID  12509789.
  • Лин CH, Чо CL, Цай WC, Ou TT, Wu CC, Yen JH, Liu HW (маусым 2006). «Ревматоидты артрит кезіндегі кБ тәрізді ген полиморфизмінің ингибиторлары». Иммунологиялық хаттар. 105 (2): 193–7. дои:10.1016 / j.imlet.2006.03.003. PMID  16644022.
  • Glas J, Török HP, Tonenchi L, Müller-Myhsok B, Mussack T, Wetzke M, Klein W, Epplen JT, Griga T, Schiemann U, Lohse P, Seiderer J, Schnitzler F, Brand S, Ochsenkühn T, Folwaczny M, Folwaczny C (2006 ж. Шілде). «NFKB1 -94ins / delATTG промотор полиморфизмінің рөлі және CARD15 / NOD2, IKBL және IL-1RN гендеріндегі полиморфизммен өзара әрекеттесуі». Ішектің қабыну аурулары. 12 (7): 606–11. дои:10.1097 / 01.ibd.0000225346.23765.6b. PMID  16804398. S2CID  25535173.
  • Koch W, Hoppmann P, Michou E, Jung V, Pfeufer A, Mueller JC, Gieger C, Wichmann HE, Meitinger T, Schömig A, Kastrati A (тамыз 2007). «BAT1-NFKBIL1-LTA геномдық аймағындағы варианттардың ассоциациясы миокард инфарктісінен қорғанумен». Адам молекулалық генетикасы. 16 (15): 1821–7. дои:10.1093 / hmg / ddm130. PMID  17517687.
  • Ramasawmy R, Faé KC, Cunha-Neto E, Borba SC, Ianni B, Mady C, Goldberg AC, Kalil J (қаңтар 2008). «IKBL / NFKBIL1 генінің промотор аймағындағы нұсқалар трипаносомалық крузи-инфекциясы бар адамдар арасында созылмалы Чагас кардиомиопатиясының дамуына бейімділікті белгілеуі мүмкін». Молекулалық иммунология. 45 (1): 283–8. дои:10.1016 / j.molimm.2007.04.015. PMID  17544510.
  • Kariz S, Milutinović A, Bregar D, Terzić I, Terzić R, Lovrecic L, Herova M, Hruskovicova H, Peterlin B, Petrovic D, Zorc-Pleskovic R (маусым 2007). «Интерлейкин-1 рецепторларының антагонист гені және каппа В-тәрізді протеин генінің полиморфизмдерінің ингибиторы 2 типті қант диабетімен ауыратын словендік популяцияда миокард инфарктісімен байланысты емес». Коллегия Antropologicum. 31 (2): 503–7. PMID  17847930.