PDLIM4 - PDLIM4

PDLIM4
Қол жетімді құрылымдар
PDB	Ортологиялық іздеу: PDBe RCSB
PDB идентификатор кодтарының тізімі
	2EEG, 2V1W, 4Q2O
Идентификаторлар
Бүркеншік аттар	PDLIM4, RIL, PDZ және LIM домені 4
Сыртқы жеке куәліктер	OMIM: 603422 MGI: 1353470 HomoloGene: 2735 Ген-карталар: PDLIM4
Геннің орналасуы (адам)
Хр.	5-хромосома (адам)
Соңы	132,273,454 bp
Геннің орналасуы (тышқан)
Хр.	11-хромосома (тышқан)
Соңы	54,069,014 bp
РНҚ экспрессиясы өрнек
	; ; ; ;
	Қосымша сілтеме өрнегі туралы деректер
Гендік онтология
Молекулалық функция	• металл ионымен байланыстыру; • GO: 0001948 ақуыздармен байланысуы; • ақуызды фосфатазамен байланыстыру; • ақуызды гомодимерлеу белсенділігі; • альфа-актининнің байланысы; • актинмен байланыстыру; • бұлшықет альфа-актининді байланыстыру;
Ұялы компонент	• стресс талшығы; • ерте эндосома люмені; • жіп тәрізді актин; • эндосома люменін қайта өңдеу; • постсинапстық мембрана; • жасуша ядросы; • цитоплазма; • эндосома; • цитоскелет; • мембрана; • ламелиподий; • жасушалық түйісу; • ерте эндосома қабығы; • жасуша проекциясы; • нейрондық проекция; • дендритикалық омыртқа; • синапс; • цитоплазманың перинуклеарлы аймағы; • эндосома мембранасын қайта өңдеу; • Z дискісі;
Биологиялық процесс	• цитиннің актинін қайта құру; • қоздырғыш химиялық синаптикалық беріліс; • жүректің дамуы; • цитиннің актинді ұйымы; • бұлшықет құрылымының дамуы;
	Дереккөздер:Амиго / QuickGO
Ортологтар
	8572
	30794
	ENSG00000131435
	ENSMUSG00000020388
	P50479
	P70271
	NM_003687; NM_001131027
	NM_019417
	NP_001124499; NP_003678
	NP_062290
	Уикидеректер
Адамды қарау / өңдеу	Тінтуірді қарау / өңдеу

PDZ және LIM домендік ақуыз 4 Бұл ақуыз адамдарда кодталған PDLIM4 ген.^[5]^[6]

Әдебиеттер тізімі

^ ^а ^б ^c GRCh38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSG00000131435 - Ансамбль, Мамыр 2017
^ ^а ^б ^c GRCm38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSMUSG00000020388 - Ансамбль, Мамыр 2017
^ «Адамның PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
^ «Mouse PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
^ Баширова А.А., Маркелов М.Л., Шлыкова Т.В., Левшенкова Е.В., Алибаева Р.А., Фролова Е.И. (маусым 1998). «Адамның RIL гені: адамның 5q31.1 хромосомасына картографиялау, геномдық ұйым және балама транскрипциялар». Джин. 210 (2): 239–45. дои:10.1016 / S0378-1119 (98) 00080-8. PMID 9573374.
^ «Entrez Gene: PDLIM4 PDZ және LIM домені 4».

Әрі қарай оқу

Маруяма К, Сугано С (1994). «Олиго-жабу: эукариоттық мРНҚ-ның қақпақ құрылымын олигорибонуклеотидтермен ауыстырудың қарапайым әдісі». Джин. 138 (1–2): 171–4. дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Сузуки Ю, Йошитомо-Накагава К, Маруяма К және т.б. (1997). «Толық көлемде байытылған және 5-деңгеймен байытылған cDNA кітапханасының құрылысы және сипаттамасы». Джин. 200 (1–2): 149–56. дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Cuppen E, van Ham M, Wansink DG және т.б. (2000). «Зиксинмен байланысты TRIP6 ақуызы RIL адаптеріндегі PDZ мотивтерімен және PTP-BL тирозинфосфатаза ақуызымен өзара әрекеттеседі». EUR. Дж. Жасуша Биол. 79 (4): 283–93. дои:10.1078 / S0171-9335 (04) 70031-X. PMID 10826496.
Walma T, Spronk CA, Tessari M және т.б. (2002). «PTP-BL екінші PDZ доменінің құрылымы, динамикасы және байланыстырушы сипаттамалары». Дж.Мол. Биол. 316 (5): 1101–10. дои:10.1006 / jmbi.2002.5402. PMID 11884147.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH және т.б. (2003). «Адам мен тышқанның 15000-нан астам толық ұзындықтағы кДНҚ тізбектерінің генерациясы және алғашқы талдауы». Proc. Натл. Акад. Ғылыми. АҚШ. 99 (26): 16899–903. дои:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Omasu F, Ezura Y, Kajita M және т.б. (2003). «PDIL-LIM домен ақуызын кодтайтын және 5q31.1-де локализацияланған, ересек жапон әйелдерінің сүйектерінің минералды тығыздығы төмен RIL генінің генетикалық вариациясының ассоциациясы». Дж. Хум. Генет. 48 (7): 342–5. дои:10.1007 / s10038-003-0035-1. PMID 12908099.
Валлениус Т, Шарм Б, Весиканса А және т.б. (2004). «PDZ-LIM ақуызы RIL актин стресс талшығының айналымын модуляциялайды және альфа-актининнің F-актинмен байланысын күшейтеді». Exp. Ұяшық Рес. 293 (1): 117–28. дои:10.1016 / j.yexcr.2003.09.004. PMID 14729062.
Лехнер Б, Сандерсон СМ (2004). «Адамның мРНҚ деградациясы үшін ақуыздың өзара әрекеттесу жүйесі». Genome Res. 14 (7): 1315–23. дои:10.1101 / гр.2122004. PMC 442147. PMID 15231747.
Герхард Д.С., Вагнер Л, Фейнголд Е.А. және т.б. (2004). «NIH толық ұзындықтағы cDNA жобасының мәртебесі, сапасы және кеңеюі: Сүтқоректілер гендерінің коллекциясы (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121-7. дои:10.1101 / гр.2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
van den Berk LC, van Ham MA, te Lindert MM, et al. (2005). «PTP-BL PDZ домендерінің RIL-мен өзара әрекеттесуі: RIL LIM домені үшін жұмбақ рөл». Мол. Биол. Rep. 31 (4): 203–15. дои:10.1007 / s11033-005-1407-8. PMID 15663004. S2CID 21554968.
Rual JF, Венкатесан К, Хао Т және т.б. (2005). «Адамның протеин-протеинмен өзара әрекеттесу желісінің протеомды масштабты картасына қарай». Табиғат. 437 (7062): 1173–8. дои:10.1038 / табиғат04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Шварц Л.М., Волошин С, Биркмейер Дж.Д. (2005). «Егде жастағы науқастар ауыр операцияға қайда баруды қалай шешеді? Телефонмен сұхбат». BMJ. 331 (7520): 821. дои:10.1136 / bmj.38614.449016.DE. PMC 1246083. PMID 16192286.
Бумбер Я.А., Кондо Ю, Чен Х, т.б. (2007). «RIL, 5q31-дегі LIM гені, қатерлі ісіктердегі метилдену арқылы тынышталады және рак клеткаларын апоптозға дейін сезімтал етеді». Қатерлі ісік ауруы. 67 (5): 1997–2005. дои:10.1158 / 0008-5472.CAN-06-3093. PMID 17332327.

Бұл мақала а ген қосулы адамның хромосомасы 5 Бұл бұта. Сіз Уикипедияға көмектесе аласыз оны кеңейту.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c GRCh38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSG00000131435 - Ансамбль, Мамыр 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSMUSG00000020388 - Ансамбль, Мамыр 2017

[3] «Адамның PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.

[4] «Mouse PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.

[pmid9573374-5] Баширова А.А., Маркелов М.Л., Шлыкова Т.В., Левшенкова Е.В., Алибаева Р.А., Фролова Е.И. (маусым 1998). «Адамның RIL гені: адамның 5q31.1 хромосомасына картографиялау, геномдық ұйым және балама транскрипциялар». Джин. 210 (2): 239–45. дои:10.1016 / S0378-1119 (98) 00080-8. PMID 9573374.

[entrez-6] «Entrez Gene: PDLIM4 PDZ және LIM домені 4».

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]