SGMS1 - SGMS1

SGMS1
Қол жетімді құрылымдар
PDBОртологиялық іздеу: PDBe RCSB
Идентификаторлар
Бүркеншік аттарSGMS1, MOB, MOB1, SMS1, TMEM23, hmob33, сфингомиелин синтазы 1
Сыртқы жеке куәліктерOMIM: 611573 MGI: 2444110 HomoloGene: 27040 Ген-карталар: SGMS1
Геннің орналасуы (адам)
10-хромосома (адам)
Хр.10-хромосома (адам)[1]
10-хромосома (адам)
SGMS1 үшін геномдық орналасу
SGMS1 үшін геномдық орналасу
Топ10q11.23Бастау50,305,586 bp[1]
Соңы50,625,163 bp[1]
РНҚ экспрессиясы өрнек
PBB GE TMEM23 212989 at fs.png
Қосымша сілтеме өрнегі туралы деректер
Ортологтар
ТүрлерАдамТышқан
Энтрез
Ансамбль
UniProt
RefSeq (mRNA)

NM_147156

NM_001168525
NM_001168526
NM_144792
NM_001362423

RefSeq (ақуыз)

NP_671512

NP_001161997
NP_001161998
NP_659041
NP_001349352

Орналасқан жері (UCSC)Хр 10: 50.31 - 50.63 МбХр 19: 32.12 - 32.39 Mb
PubMed іздеу[3][4]
Уикидеректер
Адамды қарау / өңдеуТінтуірді қарау / өңдеу

Фосфатидилхолин: керамидті холинефосфотрансфераза 1 болып табылады фермент адамдарда кодталған SGMS1 ген.[5][6][7]

Функция

Осы генмен кодталған ақуыз бес жолақты трансмембраналық ақуыз деп болжануда. Бұл ген негізінен мида көрсетілген болуы мүмкін.[7]

Үлгілі организмдер

Үлгілі организмдер SGMS1 функциясын зерттеу кезінде қолданылған. Шартты тінтуір желі деп аталады Sgms1tm1a (EUCOMM) Wtsi кезінде құрылды Wellcome Trust Sanger институты.[8] Еркек пен аналық жануарлар стандартталған түрде өтті фенотиптік экран[9] жоюдың әсерін анықтау.[10][11][12][13] Қосымша экрандар орындалды: - терең иммунологиялық фенотиптеу[14]

Әдебиеттер тізімі

  1. ^ а б c GRCh38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSG00000198964 - Ансамбль, Мамыр 2017
  2. ^ а б c GRCm38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSMUSG00000040451 - Ансамбль, Мамыр 2017
  3. ^ «Адамның PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
  4. ^ «Mouse PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
  5. ^ Владиченская И.П., Дергунова Л.В., Лимборска SA (ақпан 2002). «Филогенетикалық консервіленген трансмембраналық ақуызды кодтайтын адамның MOB генінің in vitro және силико-анализінде». Биомолекулярлық инженерия. 18 (6): 263–8. дои:10.1016 / S1389-0344 (01) 00110-1. PMID  11841947.
  6. ^ Ямаока С, Мияджи М, Китано Т, Умехара Х, Оказаки Т (сәуір 2004). «Сфингомиелин синтезін және сфингомиелин синтаза-ақаулы лимфоидты жасушаларда жасуша өсуін қалпына келтіретін адамның кДНҚ экспрессиясын клондау». Биологиялық химия журналы. 279 (18): 18688–93. дои:10.1074 / jbc.M401205200. PMID  14976195.
  7. ^ а б «Entrez Gene: TMEM23 трансмембраналық ақуыз 23».
  8. ^ Гердин А.К. (2010). «Sanger Mouse Genetics бағдарламасы: нокаут тышқандарының жоғары сипаттамасы». Acta Ophthalmologica. 88: 925–7. дои:10.1111 / j.1755-3768.2010.4142.x. S2CID  85911512.
  9. ^ а б «Халықаралық тышқан фенотиптеу консорциумы».
  10. ^ Skarnes WC, Rosen B, West AP, Koutsourakis M, Bushell W, Iyer V, Mujica AO, Thomas M, Harrow J, Cox T, Jackson D, Severin J, Biggs P, Fu J, Nefedov M, de Jong PJ, Стюарт AF, Bradley A (маусым 2011). «Тышқанның генінің қызметін геном бойынша зерттеу үшін шартты нокаут ресурсы». Табиғат. 474 (7351): 337–42. дои:10.1038 / табиғат10163. PMC  3572410. PMID  21677750.
  11. ^ Dolgin E (маусым 2011). «Тышқан кітапханасы нокаутқа айналды». Табиғат. 474 (7351): 262–3. дои:10.1038 / 474262a. PMID  21677718.
  12. ^ Коллинз Ф.С., Россант Дж, Вурст В (қаңтар 2007). «Барлық себептер бойынша тышқан». Ұяшық. 128 (1): 9–13. дои:10.1016 / j.cell.2006.12.018. PMID  17218247. S2CID  18872015.
  13. ^ White JK, Gerdin AK, Karp NA, Ryder E, Buljan M, Bussell JN, Salisbury J, Clare S, Ingham NJ, Podrini C, Houghton R, Estabel J, Bottomley JR, Melvin DG, Sunter D, Adams NC, Tannahill D , Logan DW, Macarthur DG, Flint J, Mahajan VB, Tsang SH, Smyth I, Watt FM, Skarnes WC, Dougan G, Adams DJ, Ramirez-Solis R, Bradley A, Steel KP (шілде 2013). «Нокаут тышқандарын жалпы геномдық генерациялау және жүйелі фенотиптеу көптеген гендердің жаңа рөлдерін ашады». Ұяшық. 154 (2): 452–64. дои:10.1016 / j.cell.2013.06.022. PMC  3717207. PMID  23870131.
  14. ^ а б «Инфекция және иммунитетті иммунофенотиптеу (3i) консорциумы».

Әрі қарай оқу