Синдикан-2 - Syndecan-2

SDC2
Идентификаторлар
Бүркеншік аттар	SDC2, CD362, HSPG, HSPG1, SYND2, синдекан 2
Сыртқы жеке куәліктер	OMIM: 142460 MGI: 1349165 HomoloGene: 2253 Ген-карталар: SDC2
Геннің орналасуы (адам)
Хр.	8-хромосома (адам)
Соңы	96,611,790 bp
Геннің орналасуы (тышқан)
Хр.	15-хромосома (тышқан)
Соңы	33,034,935 bp
РНҚ экспрессиясы өрнек
	; ; ; ;
	Қосымша сілтеме өрнегі туралы деректер
Гендік онтология
Молекулалық функция	• PDZ доменін байланыстыру; • GO: 0001948 ақуыздармен байланысуы; • бірдей ақуыздармен байланысуы;
Ұялы компонент	• мембрананың ажырамас компоненті; • мембрана; • жасуша қабығы; • лизосомалық люмен; • Гольджи люмені; • эндоплазмалық тор люмені; • жасуша беті; • жасушадан тыс матрица; • коллаген бар жасушадан тыс матрица;
Биологиялық процесс	• гликозаминогликанның метаболикалық процесі; • жасушалардың дифференциациясы; • эфринді рецепторлық сигнал беру жолы; • жүйке жүйесінің дамуы; • ретиноидты метаболизм процесі; • дендрит морфогенезінің реттелуі; • биолюминесценция; • гликозаминогликанның катаболикалық процесі; • гликозаминогликанның биосинтетикалық процесі; • лейкоциттердің миграциясы; • аудармадан кейінгі модификация; • жасушалық ақуыздың метаболизм процесі; • жасуша миграциясы; • дендрит морфогенезі; • биологиялық процесс;
	Дереккөздер:Амиго / QuickGO
Ортологтар
	6383
	15529
	ENSG00000169439
	ENSMUSG00000022261
	P34741
	P43407
	NM_002998
	NM_008304
	NP_002989
	NP_032330
	Уикидеректер
Адамды қарау / өңдеу	Тінтуірді қарау / өңдеу

Синдикан-2 Бұл ақуыз адамдарда кодталған SDC2 ген.^[5]

Функция

Бұл генмен кодталған ақуыз трансмембрана (І тип) гепаран сульфаты болып табылады протеогликан және синдекан протеогликандар отбасының мүшесі. Синдикаттар ВИЧ-1 тат ақуызын интерьеризациялау үшін жасушаларды байланыстыру, жасушалық сигнал беру және цитоскелеттік ұйым және синдекан рецепторлары үшін қажет. Синдикан-2 ақуызы интегралды мембраналық ақуыз ретінде қызмет етеді және жасушадан тыс матрицалық ақуыздарға арналған рецепторы арқылы жасушалардың көбеюіне, жасушалардың миграциясына және жасуша-матрицалық өзара әрекеттесуге қатысады. Өзгертілген синдекан-2 экспрессиясы бірнеше түрлі ісік түрлерінде анықталды.^[6]

Өзара әрекеттесу

SDC2 көрсетілген өзара әрекеттесу бірге:

Пайдаланылған әдебиеттер

^ ^а ^б ^c GRCh38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSG00000169439 - Ансамбль, Мамыр 2017
^ ^а ^б ^c GRCm38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSMUSG00000022261 - Ансамбль, Мамыр 2017
^ «Адамның PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
^ «Mouse PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
^ Дэвид Г, Бай XM, Ван дер Шуерен Б, Мэринен П, Кассиман Дж., Ван ден Берг Х (маусым 1994). «Тышқанның эмбрионалды дамуы кезіндегі фиброгликанның (синдекан-2) экспрессиясының кеңістіктік және уақыттық өзгерістері». Даму. 119 (3): 841–54. PMID 8187643.
^ «Entrez Gene: SDC2 syndecan 2».
^ Максимов А, Тан Т.С., Безпрозванный I (ақпан 2003). «Нейрондарда 4,1N ақуызы бар 1 типті инозитол (1,4,5) -трисфосфат рецепторының ассоциациясы». Мол. Ұяшық. Нейросчи. 22 (2): 271–83. дои:10.1016 / s1044-7431 (02) 00027-1. PMID 12676536. S2CID 2317354.
^ Cohen AR, Woods DF, Marfatia SM, Walther Z, Chishti AH, Anderson JM, Wood DF (шілде 1998). «Адам CASK / LIN-2 синдекан-2 мен ақуызды 4.1 байланыстырады және эпителий жасушаларының базолальды мембранасына локализацияланады». Дж. Жасуша Биол. 142 (1): 129–38. дои:10.1083 / jcb.142.1.129. PMC 2133028. PMID 9660868.
^ Utani A, Nomizu M, Matsuura H, Kato K, Kobayashi T, Takeda U, Aota S, Nielsen PK, Shinkai H (тамыз 2001). «Ламиннің альфа 3 G доменінің бірізділігі гепаринмен байланысады және синдекан-2 және -4 арқылы жасушалардың адгезиясына ықпал етеді». Дж.Биол. Хим. 276 (31): 28779–88. дои:10.1074 / jbc.M101420200. PMID 11373281.
^ Granés F, Urena JM, Rocamora N, Vilaró S (сәуір 2000). «Эзрин синдекан-2-ді цитоскелетке байланыстырады». J. Cell Sci. 113 (Pt 7): 1267-76. PMID 10704377.

Әрі қарай оқу

Mahley RW, Ji ZS (1999). «Липопротеидтердің қалдық метаболизмі: гепаран сульфатының протеогликандары мен жасуша беті қатысатын негізгі жолдар». J. Lipid Res. 40 (1): 1–16. PMID 9869645.
Labarrere CA, Pitts D, Halbrook H, Faulk WP (1992). «Адамның қалыпты және трансплантацияланған жүрегіндегі антикоагулянттық жолдар». J. Жүректің өкпе трансплантациясы. 11 (2 Pt 1): 342-7. PMID 1315572.
Marynen P, Zhang J, Cassiman JJ, Van den Berghe H, David G (1989). «Өкпе фибробласттарының жасушалық бетімен байланысқан гепаран сульфаты протеогликандарының 48- және 90-килодальтонды негізгі ақуыздарының ішінара бастапқы құрылымы. Интегралды мембраналық доменді болжау және адамның өкпе фибробласттарының жасуша бетіндегі бірнеше өзекті белоктарға дәлелдемелер». Дж.Биол. Хим. 264 (12): 7017–24. PMID 2523388.
Sage H, Vernon RB, Funk SE, Everitt EA, Angello J (1989). «SPARC, жасушалық пролиферациямен байланысты бөлінетін ақуыз, in vitro жасушаның таралуын тежейді және жасушадан тыс матрицамен Са + 2 тәуелді байланысын көрсетеді». Дж. Жасуша Биол. 109 (1): 341–56. дои:10.1083 / jcb.109.1.341. PMC 2115491. PMID 2745554.
Lories V, De Boeck H, David G, Cassiman JJ, Van den Berghe H (1987). «Адамның өкпе фибробласттарының гепаран сульфаты протеогликандары. Гидрофобты жасушамен байланысқан формалардың негізгі ақуыздарының құрылымдық гетерогендігі». Дж.Биол. Хим. 262 (2): 854–9. PMID 2948951.
Браун КДж, Париж CR (1994). «Гистидинге бай гликопротеин және тромбоциттер факторы-4 гепаран сульфаты протеогликандарының қышқылды және негізгі фибробласт өсу факторымен танылған маскасы». Биохимия. 33 (46): 13918–27. дои:10.1021 / bi00250a047. PMID 7524669.
Болтон П, Пауэлл Дж, Руттер М, Букл V, Йейтс Дж.Р., Исикава-Қылқалам Y, Монако AP (1995). «Аутизм, ақыл-ойдың артта қалуы, 46, X, t (X; 8) бар әйелде көптеген экзостоздар және қысқа бойлық (p22.13; q22.1)». Психиатр. Генет. 5 (2): 51–5. дои:10.1097/00041444-199522000-00001. PMID 7551962. S2CID 45132642.
Barillari G, Gendelman R, Gallo RC, Ensoli B (1993). «Адамның иммунитет тапшылығы вирусының 1 типті Тат протеині, СПИД-тің өсу факторы Капоши саркомасы және цитокинмен белсендірілген тамыр жасушалары, RGD аминқышқылдарының ретін танитын интегрин рецепторларын қолдану арқылы сол жасуша типтерінің адгезиясын тудырады». Proc. Натл. Акад. Ғылыми. АҚШ. 90 (17): 7941–5. дои:10.1073 / pnas.90.17.7941. PMC 47263. PMID 7690138.
Лион М, Дэакин Дж.А., Мизуно К, Накамура Т, Галлахер Дж.Т. (1994). «Гепатоциттердің өсу факторының гепаран сульфатымен өзара әрекеттесуі. Гепаран сульфатының негізгі құрылымдық детерминанттарын түсіндіру». Дж.Биол. Хим. 269 (15): 11216–23. PMID 8157651.
Albini A, Benelli R, Presta M, Rusnati M, Ziche M, Rubartelli A, Paglialunga G, Bussolino F, Noanan D (1996). «ВИЧ-тат ақуызы - гепаринмен байланысатын ангиогендік өсу факторы». Онкоген. 12 (2): 289–97. PMID 8570206.
Soussi-Yanicostas N, Hardelin JP, Arroyo-Jimenez MM, Ardouin O, Legueis R, Levilliers J, Traincard F, Betton JM, Cabanié L, Petit C (1997). «Аносмин-1-дің бастапқы сипаттамасы, орталық жүйке жүйесіндегі белгілі нейрондық жасушалар популяциясы арқылы синтезделген жасушадан тыс матрицалық протеин». J. Cell Sci. 109 (7): 1749–57. PMID 8832397.
Christa L, Carnot F, Simon MT, Levavasseur F, Stinnakre MG, Lasserre C, Thepot D, Clement B, Devinoy E, Brechot C (1997). «HIP / PAP - бұл гепатокарциномада, қалыпты Панетте және ұйқы безі жасушаларында көрсетілген адгезиялық ақуыз». Am. Дж. Физиол. 271 (6 Pt 1): G993–1002. дои:10.1152 / ajpgi.1996.271.6.G993. PMID 8997243.
Rusnati M, Coltrini D, Oreste P, Zoppetti G, Albini A, Noanan D, d'Adda di Fagagna F, Giacca M, Presta M (1997). «ВИЧ-1 Тат ақуызының гепаринмен өзара әрекеттесуі. Магистраль құрылымының рөлі, сульфациясы және мөлшері». Дж.Биол. Хим. 272 (17): 11313–20. дои:10.1074 / jbc.272.17.11313. PMID 9111037.
Oh ES, Couchman JR, Woods A (1997). «Синдекан-2 протеогликан цитоплазмалық доменінің сериндік фосфорлануы». Арка. Биохимия. Биофиз. 344 (1): 67–74. дои:10.1006 / abbi.1997.0180. PMID 9244383.
Ишикава-Қылқалам Y, Пауэлл Дж.Ф., Болтон П, Миллер А.П., Фрэнсис Ф, Виллард Х.Ф., Лехрах Х, Монако AP (1997). «Аутизм және көптеген экзостоздар, X; 8 транслокация GRPR генінде және 3 'SDC2 генінде болады». Хум. Мол. Генет. 6 (8): 1241–50. дои:10.1093 / hmg / 6.8.1241. PMID 9259269.
Chang HC, Samaniego F, Nair BC, Buonaguro L, Ensoli B (1997). «ВИЧ-1 Тат ақуызы жасушалардан көшбасшы секреторлық жол арқылы шығады және жасушадан тыс матрицамен байланысқан гепаран сульфатының протеогликандарымен байланысады». ЖИТС. 11 (12): 1421–31. дои:10.1097/00002030-199712000-00006. PMID 9342064. S2CID 7648619.
Grootjans JJ, Zimmermann P, Reekmans G, Smets A, Degeest G, Dürr J, David G (1998). «Синтенин, синдеканды цитоплазмалық домендерді байланыстыратын PDZ ақуызы». Proc. Натл. Акад. Ғылыми. АҚШ. 94 (25): 13683–8. дои:10.1073 / pnas.94.25.13683. PMC 28366. PMID 9391086.
Коэн А.Р., Вудс DF, Марфатия С.М., Уолтер З, Чишти А.Х., Андерсон Дж.М., Вуд DF (1998). «Адам CASK / LIN-2 синдекан-2 мен ақуызды 4.1 байланыстырады және эпителий жасушаларының базолальды мембранасына локализацияланады». Дж. Жасуша Биол. 142 (1): 129–38. дои:10.1083 / jcb.142.1.129. PMC 2133028. PMID 9660868.

Бұл мақала а ген қосулы адамның хромосомасы 8 Бұл бұта. Сіз Уикипедияға көмектесе аласыз оны кеңейту.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c GRCh38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSG00000169439 - Ансамбль, Мамыр 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSMUSG00000022261 - Ансамбль, Мамыр 2017

[3] «Адамның PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.

[4] «Mouse PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.

[pmid8187643-5] Дэвид Г, Бай XM, Ван дер Шуерен Б, Мэринен П, Кассиман Дж., Ван ден Берг Х (маусым 1994). «Тышқанның эмбрионалды дамуы кезіндегі фиброгликанның (синдекан-2) экспрессиясының кеңістіктік және уақыттық өзгерістері». Даму. 119 (3): 841–54. PMID 8187643.

[entrez-6] «Entrez Gene: SDC2 syndecan 2».

[pmid12676536-7] Максимов А, Тан Т.С., Безпрозванный I (ақпан 2003). «Нейрондарда 4,1N ақуызы бар 1 типті инозитол (1,4,5) -трисфосфат рецепторының ассоциациясы». Мол. Ұяшық. Нейросчи. 22 (2): 271–83. дои:10.1016 / s1044-7431 (02) 00027-1. PMID 12676536. S2CID 2317354.

[pmid9660868-8] Cohen AR, Woods DF, Marfatia SM, Walther Z, Chishti AH, Anderson JM, Wood DF (шілде 1998). «Адам CASK / LIN-2 синдекан-2 мен ақуызды 4.1 байланыстырады және эпителий жасушаларының базолальды мембранасына локализацияланады». Дж. Жасуша Биол. 142 (1): 129–38. дои:10.1083 / jcb.142.1.129. PMC 2133028. PMID 9660868.

[pmid11373281-9] Utani A, Nomizu M, Matsuura H, Kato K, Kobayashi T, Takeda U, Aota S, Nielsen PK, Shinkai H (тамыз 2001). «Ламиннің альфа 3 G доменінің бірізділігі гепаринмен байланысады және синдекан-2 және -4 арқылы жасушалардың адгезиясына ықпал етеді». Дж.Биол. Хим. 276 (31): 28779–88. дои:10.1074 / jbc.M101420200. PMID 11373281.

[pmid10704377-10] Granés F, Urena JM, Rocamora N, Vilaró S (сәуір 2000). «Эзрин синдекан-2-ді цитоскелетке байланыстырады». J. Cell Sci. 113 (Pt 7): 1267-76. PMID 10704377.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]