Синдикан-4 - Syndecan-4

SDC4
Protein SDC4 PDB 1ejp.png
Қол жетімді құрылымдар
PDBОртологиялық іздеу: PDBe RCSB
Идентификаторлар
Бүркеншік аттарSDC4, SYND4, синдекан 4
Сыртқы жеке куәліктерOMIM: 600017 MGI: 1349164 HomoloGene: 31121 Ген-карталар: SDC4
Геннің орналасуы (адам)
20-хромосома (адам)
Хр.20-хромосома (адам)[1]
20-хромосома (адам)
Genomic location for SDC4
Genomic location for SDC4
Топ20q13.12Бастау45,325,288 bp[1]
Соңы45,348,424 bp[1]
РНҚ экспрессиясы өрнек
PBB GE SDC4 202071 at fs.png
Қосымша сілтеме өрнегі туралы деректер
Ортологтар
ТүрлерАдамТышқан
Энтрез

6385

20971

Ансамбль

ENSG00000124145

ENSMUSG00000017009

UniProt

P31431

O35988

RefSeq (mRNA)

NM_002999

NM_011521

RefSeq (ақуыз)

NP_002990

NP_035651

Орналасқан жері (UCSC)Хр 20: 45.33 - 45.35 МбChr 2: 164.42 - 164.44 Mb
PubMed іздеу[3][4]
Уикидеректер
Адамды қарау / өңдеуТінтуірді қарау / өңдеу

Синдикан-4 Бұл ақуыз адамдарда кодталған SDC4 ген.[5][6] Синдекан-4 - бұл омыртқалы төрт синдеканның бірі және оның молекулалық салмағы ~ 20 кДа. Синдикандар - плазмалық мембраналық протеогликандардың ең жақсы сипаттамасы. Олардың негізгі жасуша ішіндегі жасуша ішілік домені актин цитоскелетімен және жасуша қыртысында сигнал беретін молекулалармен әрекеттеседі. Синдикандар әдетте фибробласттар мен эпителий жасушаларының жасуша бетінде кездеседі. Синдикандар жасуша бетіндегі фибронектинмен, жасуша ішіндегі цитоскелеталық және сигналдық белоктармен өзара әрекеттесіп, жасуша-матрицалық адгезиядағы интегрин функциясын модуляциялайды. Сондай-ақ, синдекандар FGF-мен байланысады және оларды FGF рецепторына әкеледі. Ко-рецептор немесе реттегіш ретінде мутацияға ұшыраған кейбір протеогликандар дамудың таралуы немесе сигнал беретін молекулалардың инактивациясы сияқты дамудың ауыр ақауларын тудыруы мүмкін.

Синдекандардың ұқсас құрылымдық ерекшеліктері бар:

  • Гепаран сульфаты тізбектеріне бекітіңіз - өзара әсерлесетін факторлар (мысалы, матрица молекулалары, өсу факторлары және ферменттер)
  • Хондроитин сульфат тізбегі
  • Трансмембраналық домен - өзін-өзі біріктіру
  • C1 домені - актин-ассоциация цитоскелеті
  • Айнымалы домен - синдикатқа тән
  • C2 домені - PDZ ақуыздарына қосылады

Синдекандар әдетте гомодимерлерді немесе мультимерлерді құрайды. Олардың биологиялық функциясы жасушалардың өсуін реттеуді, дифференциацияны және адгезияны қамтиды. Syndecan-4 басқа синдекандарға қарағанда кең таралған және бұл фокальды адгезия кезінде үнемі кездесетін жалғыз синдекан.[7]

Джин

Синдекан-4 рудокан немесе амфигликан деп те аталады. Ол 20 хромосомасында кездеседі, ал а псевдоген 22 хромосомасында табылған.[8] Синдекан-4 - бұл омыртқалы төрт синдеканның бірі және оның молекулалық салмағы ~ 20 кДа. Ол басқа синдекандарға қарағанда кең таралған және бұл фокальды адгезия кезінде тұрақты түрде табылған жалғыз синдекан.[9]

Функция

Syndecan-4 - трансмембраналық (I типті) гепаран сульфаты жасушаішілік сигнал беру кезінде рецептор ретінде жұмыс жасайтын протеогликан. Ақуыз гомодимер ретінде кездеседі және оның мүшесі болып табылады синдекан протеогликан отбасы.[8] Syndecan-4 жасушадан тыс матрицамен, антикоагулянттармен және өсу факторларымен әрекеттеседі. Сонымен қатар, ол актин цитоскелетін, жасушалардың адгезиясын және жасушалардың миграциясын реттейді.[10]

Синдекан-4 сигналды өткізуге қатысатын ақуыз С (PKC) ферментін белсендіреді.[11] Syndecan-4 айнымалы домені өзін-өзі біріктіру сайты болуы мүмкін. Олигомеризация дәрежесі киназалар активтілігімен корреляциялайды, сондықтан синдекан-4 кластерлену дәрежесі ПКК белсенділігімен корреляцияланады.[12] Синдекан-4 айнымалы домен арқылы фосфатидилинозитолмен (4,5) -бисфосфатпен (PIP2) байланысады және PKC белсенділігін он есе арттырады.[13]

Syndecan-4 сонымен қатар фибробласт өсу факторы-2 (FGF-2) сигнализациясының реттеушісі болып табылады. Syndecan-4 FGF-мен байланысады және FGF рецепторымен өзара әрекеттеседі.[14] Синдикан-4 пен өсу факторлары арасындағы тығыз корреляция болғандықтан, ангиогендік терапияның тиімділігі синдекан-4-ке қатысты деп есептелді. Өсу факторы туралы сигнал синдекан-4 экспрессиясының өзгеруімен бұзылуы мүмкін.[15][16][17] FGF-2-ді жасушалық сіңіру, сату және ядролық оқшаулау синдекан-4 протеолипосомаларын бірге жеткізу арқылы ұлғайтылуы мүмкін. Бұл өзгертулер FGF-2 негізіндегі терапияда қарастырылуы керек.[18]

Syndecan-4 емдеу үдерісімен де байланысты. Sdc4 генінің жетіспеуі тышқандардағы жараның кеш емделуіне әкеледі. Бұл кешігу бұзылған фибробласт моторикасына байланысты болуы мүмкін.[19]

Клиникалық маңызы

Эндометриоз

Syndecan-4 өрнегі эндометрия зардап шегетін әйелдер эндометриоз және оның эндометриотикалық жасушалардағы регуляциясы инвазивті өсудің төмендеуіне және кіші ГТПаза экспрессиясының төмендеуіне әкеледі Rac1, Транскрипция коэффициенті 2 (ATF2), және MMP3. [20]

Остеоартрит

Syndecan-4 жаңартылған артроз және синдекан-4 тежелуі ОА тышқан модельдерінде шеміршектің жойылуын азайтады.[21]

Sindecán-4-ті испандық Википедиядан қараңыз

Пайдаланылған әдебиеттер

  1. ^ а б c GRCh38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSG00000124145 - Ансамбль, Мамыр 2017
  2. ^ а б c GRCm38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSMUSG00000017009 - Ансамбль, Мамыр 2017
  3. ^ «Адамның PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
  4. ^ «Mouse PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
  5. ^ Кожима Т, Иназава Дж, Такамацу Дж, Розенберг RD, Сайто Н (наурыз 1993). «Адамның рудоканның негізгі ақуызы: кДНҚ-ны молекулалық клондау және сипаттамасы, және геннің хромосомалық оқшаулануы». Биохимия Biofhys Res Commun. 190 (3): 814–22. дои:10.1006 / bbrc.1993.1122. PMID  7916598.
  6. ^ Дэвид Г, ван дер Шуерен Б, Мэринен П, Кассиман Дж., Ван ден Берг Х (қыркүйек 1992). «Амфигликанды молекулалық клондау, эпителий және фибробластикалық жасушалармен өрнектелген гепаран сульфаты протеогликанның жаңа интегралды мембранасы». J Cell Biol. 118 (4): 961–9. дои:10.1083 / jcb.118.4.961. PMC  2289559. PMID  1500433.
  7. ^ Woods A, Couchman JR (1994). «Syndecan 4 гепаран сульфаты протеогликан - таңдамалы байытылған және кең таралған фокалды адгезия компоненті». Мол Биол Жасушасы. 5 (2): 183–192. дои:10.1091 / mbc.5.2.183. PMC  301024. PMID  8019004.
  8. ^ а б «Entrez Gene: SDC4 syndecan 4».
  9. ^ Woods A, Couchman JR (ақпан 1994). «Syndecan 4 гепаран сульфаты протеогликан - таңдамалы байытылған және кең таралған фокалды адгезия компоненті». Мол. Биол. Ұяшық. 5 (2): 183–92. дои:10.1091 / mbc.5.2.183. PMC  301024. PMID  8019004.
  10. ^ Woods A, Couchman JR (мамыр 1998). «Синдекандар: жасушалардың адгезиясының синергетикалық активаторлары». Трендтер Жасуша Биол. 8 (5): 189–92. дои:10.1016 / S0962-8924 (98) 01244-6. PMID  9695837.
  11. ^ Hyatt SL, Klauck T, Jaken S (1990). «Ақуыздың киназасы С, қалыпты, бірақ трансформацияланбаған фибробласттардың фокалды байланыстарында локализацияланған». Мол. Канцерог. 3 (2): 45–53. дои:10.1002 / mc.2940030202. PMID  2161238. S2CID  46254921.
  12. ^ Grootjans JJ, Zimmermann P, Reekmans G, Smets A, Degeest G, Dürr J, David G (желтоқсан 1997). «Синтенин, синдеканды цитоплазмалық домендерді байланыстыратын PDZ ақуызы». Proc. Натл. Акад. Ғылыми. АҚШ. 94 (25): 13683–8. Бибкод:1997 PNAS ... 9413683G. дои:10.1073 / pnas.94.25.13683. PMC  28366. PMID  9391086.
  13. ^ Oh ES, Woods A, Couchman JR (мамыр 1997). «Синдекан-4 цитоплазмалық доменін мультимеризациялау оның ақуызды киназа С-ны активтендіру қабілеті үшін қажет». Дж.Биол. Хим. 272 (18): 11805–11. дои:10.1074 / jbc.272.18.11805. PMID  9115237.
  14. ^ Chua CC, Rahimi N, Forsten-Williams Williams, Nugent MA (ақпан 2004). «Гепаран сульфаты протеогликандары фибробласт өсу факторы-2 жасушадан тыс сигналмен реттелетін киназалар 1 және 2 активациясының рецепторлары ретінде жұмыс істейді». Шеңбер Res. 94 (3): 316–23. дои:10.1161 / 01.RES.0000112965.70691.AC. PMID  14684627.
  15. ^ Бортоф К.Д., Вагнер В.Д. (2005 ж. Ақпан). «Пролиферациясы күшейтілген артериялық тегіс бұлшықет жасушаларында синдекан-4 экспрессиясының төмендеуі». Exp. Мол. Патол. 78 (1): 10–6. дои:10.1016 / j.yexmp.2004.08.010. PMID  15596055.
  16. ^ Neelapu SS, Gause BL, Harvey L, Lee ST, Frye AR, Horton J, Robb RJ, Popescu MC, Kwak LW (маусым 2007). «Протеолипозомалық жаңа вакцина фолликулярлық лимфомаға қарсы ісікке қарсы иммунитетті тудырады». Қан. 109 (12): 5160–3. дои:10.1182 / қан-2006-12-063594. PMC  1941785. PMID  17339422.
  17. ^ Olsson U, Bondjers G, Camejo G (наурыз 1999). «Май қышқылдары өсірілген адамның артериялық тегіс бұлшықет жасушаларында жасушадан тыс матрицаның құрамын протеогликанның негізгі ақуыздарының гендерінің экспрессиясын өзгерту арқылы модуляциялайды». Қант диабеті. 48 (3): 616–22. дои:10.2337 / қант диабеті.48.3.616. PMID  10078565.
  18. ^ Джанг Е, Альбадави Х, Уоткинс М.Т., Эдельман Э.Р., Бейкер А.Б. (қаңтар 2012). «Syndecan-4 протеолипозомалары ишемиялық бұлшықеттің көбеюін, миграциясын және неоваскуляризациясынан туындаған фибробласттың өсу факторын-2 (FGF-2) күшейтеді». Proc. Натл. Акад. Ғылыми. АҚШ. 109 (5): 1679–84. Бибкод:2012PNAS..109.1679J. дои:10.1073 / pnas.1117885109. PMC  3277125. PMID  22307630.
  19. ^ Echtermeyer F, Streit M, Wilcox-Adelman S, Saoncella S, Denhez F, Detmar M, Goetinck P (қаңтар 2001). «Синдикан-4 жетіспейтін тышқандардағы жараларды қалпына келтіру және ангиогенездің бұзылуы». J. Clin. Инвестиция. 107 (2): R9-R14. дои:10.1172 / JCI10559. PMC  199172. PMID  11160142.
  20. ^ Челариу-Райку, Анка; Уилке, Корнелия; Бренд, Мелани; Старзинский-Повиц, Анна; Кизель, Людвиг; Шюринг, Андреас Н; Гетте, Мартин (2016). «Синдекан-4 экспрессиясы эндометриоз кезінде реттеледі және инвазиялық фенотипке ықпал етеді». Ұрықтану және стерильділік. 106 (2): 378–85. дои:10.1016 / j.fertnstert.2016.03.032. PMID  27041028.
  21. ^ Hass MJ (қыркүйек 2009). «SDC4: OA бірлескен күш». SciBX. 2 (34): 1297. дои:10.1038 / scibx.2009.1297.

Әрі қарай оқу

Сыртқы сілтемелер

  • Сайтында қол жетімді барлық құрылымдық ақпаратқа шолу PDB үшін UniProt: P31431 (Syndecan-4) PDBe-KB.